Protein–RNA interactions for Protein: P62983

Rps27a, Ubiquitin-40S ribosomal protein S27a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps27aP62983 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rps27aP62983 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rps27aP62983 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rps27aP62983 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rps27aP62983 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rps27aP62983 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rps27aP62983 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rps27aP62983 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Rps27aP62983 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rps27aP62983 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rps27aP62983 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Rps27aP62983 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rps27aP62983 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rps27aP62983 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rps27aP62983 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rps27aP62983 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rps27aP62983 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Rps27aP62983 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rps27aP62983 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rps27aP62983 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rps27aP62983 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rps27aP62983 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rps27aP62983 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rps27aP62983 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Rps27aP62983 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rps27aP62983 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rps27aP62983 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rps27aP62983 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rps27aP62983 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rps27aP62983 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rps27aP62983 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Rps27aP62983 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Rps27aP62983 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rps27aP62983 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Rps27aP62983 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rps27aP62983 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rps27aP62983 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rps27aP62983 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rps27aP62983 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rps27aP62983 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rps27aP62983 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Rps27aP62983 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Rps27aP62983 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rps27aP62983 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rps27aP62983 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rps27aP62983 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rps27aP62983 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rps27aP62983 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rps27aP62983 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rps27aP62983 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rps27aP62983 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rps27aP62983 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rps27aP62983 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rps27aP62983 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rps27aP62983 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rps27aP62983 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rps27aP62983 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rps27aP62983 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rps27aP62983 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rps27aP62983 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rps27aP62983 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rps27aP62983 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rps27aP62983 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rps27aP62983 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rps27aP62983 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rps27aP62983 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rps27aP62983 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rps27aP62983 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rps27aP62983 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rps27aP62983 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rps27aP62983 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rps27aP62983 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rps27aP62983 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rps27aP62983 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rps27aP62983 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rps27aP62983 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rps27aP62983 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rps27aP62983 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rps27aP62983 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rps27aP62983 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rps27aP62983 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rps27aP62983 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rps27aP62983 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rps27aP62983 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rps27aP62983 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rps27aP62983 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Rps27aP62983 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Rps27aP62983 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Rps27aP62983 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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