Protein–RNA interactions for Protein: P62737

Acta2, Actin, aortic smooth muscle, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta2P62737 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Acta2P62737 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Acta2P62737 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Acta2P62737 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Acta2P62737 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Acta2P62737 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Acta2P62737 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Acta2P62737 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Acta2P62737 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Acta2P62737 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Acta2P62737 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Acta2P62737 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Acta2P62737 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Acta2P62737 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Acta2P62737 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Acta2P62737 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Acta2P62737 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Acta2P62737 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Acta2P62737 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Acta2P62737 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Acta2P62737 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Acta2P62737 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Acta2P62737 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Acta2P62737 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Acta2P62737 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Acta2P62737 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Acta2P62737 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Acta2P62737 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Acta2P62737 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Acta2P62737 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Acta2P62737 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Acta2P62737 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Acta2P62737 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Acta2P62737 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Acta2P62737 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Acta2P62737 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Acta2P62737 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Acta2P62737 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Acta2P62737 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Acta2P62737 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Acta2P62737 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Acta2P62737 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Acta2P62737 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Acta2P62737 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Acta2P62737 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Acta2P62737 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Acta2P62737 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Acta2P62737 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Acta2P62737 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Acta2P62737 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Acta2P62737 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Acta2P62737 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Acta2P62737 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Acta2P62737 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Acta2P62737 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Acta2P62737 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Acta2P62737 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Acta2P62737 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Acta2P62737 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Acta2P62737 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Acta2P62737 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Acta2P62737 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Acta2P62737 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Acta2P62737 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Acta2P62737 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Acta2P62737 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Acta2P62737 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Acta2P62737 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Acta2P62737 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Acta2P62737 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acta2P62737 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acta2P62737 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acta2P62737 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acta2P62737 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acta2P62737 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acta2P62737 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acta2P62737 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acta2P62737 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Acta2P62737 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acta2P62737 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acta2P62737 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acta2P62737 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acta2P62737 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acta2P62737 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acta2P62737 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acta2P62737 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acta2P62737 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acta2P62737 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acta2P62737 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acta2P62737 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Acta2P62737 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Acta2P62737 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Acta2P62737 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Acta2P62737 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Acta2P62737 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Acta2P62737 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Acta2P62737 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Acta2P62737 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Acta2P62737 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Acta2P62737 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms