Protein–RNA interactions for Protein: P62322

Lsm5, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm5, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm5P62322 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lsm5P62322 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Lsm5P62322 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lsm5P62322 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lsm5P62322 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lsm5P62322 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lsm5P62322 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lsm5P62322 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Lsm5P62322 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lsm5P62322 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lsm5P62322 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lsm5P62322 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lsm5P62322 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lsm5P62322 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lsm5P62322 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lsm5P62322 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lsm5P62322 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lsm5P62322 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lsm5P62322 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lsm5P62322 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lsm5P62322 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lsm5P62322 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lsm5P62322 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Lsm5P62322 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lsm5P62322 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lsm5P62322 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Lsm5P62322 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lsm5P62322 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lsm5P62322 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lsm5P62322 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lsm5P62322 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lsm5P62322 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lsm5P62322 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lsm5P62322 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lsm5P62322 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lsm5P62322 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lsm5P62322 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lsm5P62322 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Lsm5P62322 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lsm5P62322 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lsm5P62322 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lsm5P62322 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lsm5P62322 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lsm5P62322 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lsm5P62322 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lsm5P62322 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lsm5P62322 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lsm5P62322 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lsm5P62322 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lsm5P62322 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lsm5P62322 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lsm5P62322 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lsm5P62322 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Lsm5P62322 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Lsm5P62322 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lsm5P62322 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Lsm5P62322 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lsm5P62322 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lsm5P62322 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lsm5P62322 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lsm5P62322 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lsm5P62322 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lsm5P62322 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lsm5P62322 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lsm5P62322 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lsm5P62322 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Lsm5P62322 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lsm5P62322 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lsm5P62322 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lsm5P62322 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lsm5P62322 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lsm5P62322 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lsm5P62322 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lsm5P62322 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lsm5P62322 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lsm5P62322 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lsm5P62322 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Lsm5P62322 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lsm5P62322 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lsm5P62322 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lsm5P62322 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Lsm5P62322 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Lsm5P62322 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Lsm5P62322 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lsm5P62322 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lsm5P62322 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lsm5P62322 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lsm5P62322 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lsm5P62322 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lsm5P62322 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lsm5P62322 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lsm5P62322 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lsm5P62322 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lsm5P62322 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lsm5P62322 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lsm5P62322 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lsm5P62322 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lsm5P62322 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lsm5P62322 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lsm5P62322 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.3 ms