Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vbp1P61759 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vbp1P61759 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vbp1P61759 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vbp1P61759 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vbp1P61759 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vbp1P61759 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vbp1P61759 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vbp1P61759 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vbp1P61759 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vbp1P61759 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vbp1P61759 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vbp1P61759 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vbp1P61759 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vbp1P61759 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vbp1P61759 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vbp1P61759 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vbp1P61759 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vbp1P61759 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vbp1P61759 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vbp1P61759 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vbp1P61759 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vbp1P61759 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vbp1P61759 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vbp1P61759 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vbp1P61759 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vbp1P61759 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vbp1P61759 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vbp1P61759 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vbp1P61759 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vbp1P61759 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vbp1P61759 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vbp1P61759 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vbp1P61759 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vbp1P61759 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vbp1P61759 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vbp1P61759 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vbp1P61759 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vbp1P61759 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vbp1P61759 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vbp1P61759 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vbp1P61759 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vbp1P61759 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vbp1P61759 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Vbp1P61759 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vbp1P61759 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vbp1P61759 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vbp1P61759 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vbp1P61759 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vbp1P61759 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vbp1P61759 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vbp1P61759 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Vbp1P61759 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vbp1P61759 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vbp1P61759 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vbp1P61759 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vbp1P61759 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vbp1P61759 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vbp1P61759 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vbp1P61759 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vbp1P61759 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vbp1P61759 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vbp1P61759 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vbp1P61759 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vbp1P61759 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vbp1P61759 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vbp1P61759 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vbp1P61759 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vbp1P61759 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vbp1P61759 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vbp1P61759 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vbp1P61759 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vbp1P61759 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vbp1P61759 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vbp1P61759 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Vbp1P61759 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vbp1P61759 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vbp1P61759 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vbp1P61759 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vbp1P61759 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vbp1P61759 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vbp1P61759 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vbp1P61759 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vbp1P61759 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vbp1P61759 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vbp1P61759 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vbp1P61759 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vbp1P61759 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vbp1P61759 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vbp1P61759 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vbp1P61759 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vbp1P61759 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vbp1P61759 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vbp1P61759 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vbp1P61759 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vbp1P61759 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vbp1P61759 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vbp1P61759 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vbp1P61759 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vbp1P61759 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms