Protein–RNA interactions for Protein: P60710

Actb, Actin, cytoplasmic 1, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ActbP60710 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ActbP60710 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ActbP60710 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ActbP60710 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ActbP60710 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ActbP60710 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ActbP60710 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ActbP60710 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ActbP60710 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ActbP60710 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ActbP60710 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ActbP60710 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ActbP60710 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ActbP60710 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ActbP60710 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ActbP60710 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ActbP60710 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ActbP60710 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ActbP60710 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ActbP60710 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ActbP60710 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ActbP60710 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ActbP60710 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ActbP60710 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ActbP60710 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ActbP60710 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ActbP60710 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ActbP60710 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ActbP60710 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ActbP60710 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ActbP60710 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ActbP60710 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ActbP60710 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ActbP60710 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ActbP60710 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ActbP60710 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ActbP60710 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ActbP60710 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ActbP60710 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ActbP60710 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ActbP60710 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ActbP60710 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ActbP60710 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ActbP60710 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ActbP60710 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ActbP60710 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ActbP60710 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ActbP60710 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ActbP60710 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ActbP60710 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ActbP60710 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ActbP60710 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ActbP60710 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ActbP60710 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ActbP60710 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ActbP60710 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ActbP60710 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ActbP60710 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ActbP60710 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ActbP60710 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ActbP60710 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ActbP60710 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ActbP60710 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ActbP60710 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ActbP60710 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ActbP60710 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ActbP60710 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ActbP60710 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ActbP60710 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ActbP60710 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ActbP60710 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ActbP60710 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ActbP60710 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ActbP60710 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ActbP60710 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ActbP60710 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ActbP60710 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ActbP60710 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ActbP60710 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ActbP60710 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ActbP60710 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ActbP60710 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ActbP60710 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ActbP60710 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ActbP60710 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ActbP60710 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ActbP60710 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ActbP60710 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ActbP60710 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ActbP60710 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ActbP60710 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ActbP60710 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ActbP60710 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ActbP60710 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ActbP60710 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ActbP60710 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ActbP60710 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ActbP60710 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ActbP60710 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ActbP60710 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms