Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ppfia3P60469 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ppfia3P60469 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ppfia3P60469 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ppfia3P60469 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ppfia3P60469 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ppfia3P60469 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ppfia3P60469 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ppfia3P60469 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ppfia3P60469 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ppfia3P60469 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ppfia3P60469 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ppfia3P60469 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ppfia3P60469 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ppfia3P60469 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ppfia3P60469 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ppfia3P60469 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ppfia3P60469 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ppfia3P60469 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ppfia3P60469 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ppfia3P60469 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ppfia3P60469 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ppfia3P60469 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ppfia3P60469 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ppfia3P60469 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ppfia3P60469 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ppfia3P60469 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ppfia3P60469 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ppfia3P60469 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ppfia3P60469 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ppfia3P60469 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Ppfia3P60469 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ppfia3P60469 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ppfia3P60469 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ppfia3P60469 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Ppfia3P60469 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Ppfia3P60469 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ppfia3P60469 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ppfia3P60469 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ppfia3P60469 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Ppfia3P60469 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ppfia3P60469 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ppfia3P60469 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Ppfia3P60469 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ppfia3P60469 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ppfia3P60469 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ppfia3P60469 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ppfia3P60469 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ppfia3P60469 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ppfia3P60469 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ppfia3P60469 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ppfia3P60469 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ppfia3P60469 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ppfia3P60469 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ppfia3P60469 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Ppfia3P60469 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Ppfia3P60469 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ppfia3P60469 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ppfia3P60469 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ppfia3P60469 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ppfia3P60469 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Ppfia3P60469 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ppfia3P60469 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ppfia3P60469 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ppfia3P60469 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ppfia3P60469 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ppfia3P60469 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ppfia3P60469 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ppfia3P60469 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ppfia3P60469 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ppfia3P60469 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ppfia3P60469 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ppfia3P60469 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ppfia3P60469 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ppfia3P60469 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ppfia3P60469 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ppfia3P60469 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ppfia3P60469 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ppfia3P60469 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ppfia3P60469 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ppfia3P60469 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ppfia3P60469 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ppfia3P60469 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ppfia3P60469 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ppfia3P60469 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ppfia3P60469 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ppfia3P60469 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ppfia3P60469 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ppfia3P60469 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ppfia3P60469 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ppfia3P60469 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ppfia3P60469 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ppfia3P60469 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ppfia3P60469 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ppfia3P60469 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ppfia3P60469 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ppfia3P60469 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ppfia3P60469 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ppfia3P60469 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ppfia3P60469 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms