Protein–RNA interactions for Protein: P59114

Pcif1, Phosphorylated CTD-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcif1P59114 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pcif1P59114 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pcif1P59114 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pcif1P59114 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pcif1P59114 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Pcif1P59114 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pcif1P59114 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pcif1P59114 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pcif1P59114 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pcif1P59114 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pcif1P59114 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pcif1P59114 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pcif1P59114 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pcif1P59114 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pcif1P59114 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Pcif1P59114 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pcif1P59114 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pcif1P59114 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pcif1P59114 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pcif1P59114 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pcif1P59114 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pcif1P59114 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pcif1P59114 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Pcif1P59114 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pcif1P59114 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pcif1P59114 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pcif1P59114 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pcif1P59114 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pcif1P59114 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pcif1P59114 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pcif1P59114 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pcif1P59114 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pcif1P59114 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pcif1P59114 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pcif1P59114 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pcif1P59114 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pcif1P59114 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pcif1P59114 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pcif1P59114 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pcif1P59114 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pcif1P59114 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pcif1P59114 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pcif1P59114 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pcif1P59114 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pcif1P59114 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pcif1P59114 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pcif1P59114 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pcif1P59114 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pcif1P59114 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pcif1P59114 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pcif1P59114 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pcif1P59114 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pcif1P59114 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pcif1P59114 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pcif1P59114 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pcif1P59114 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pcif1P59114 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pcif1P59114 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pcif1P59114 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Pcif1P59114 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pcif1P59114 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Pcif1P59114 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pcif1P59114 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Pcif1P59114 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pcif1P59114 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pcif1P59114 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pcif1P59114 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pcif1P59114 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Pcif1P59114 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pcif1P59114 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pcif1P59114 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pcif1P59114 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pcif1P59114 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pcif1P59114 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pcif1P59114 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pcif1P59114 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pcif1P59114 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pcif1P59114 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pcif1P59114 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pcif1P59114 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pcif1P59114 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pcif1P59114 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pcif1P59114 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pcif1P59114 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pcif1P59114 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pcif1P59114 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pcif1P59114 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pcif1P59114 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pcif1P59114 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pcif1P59114 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pcif1P59114 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pcif1P59114 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pcif1P59114 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pcif1P59114 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pcif1P59114 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pcif1P59114 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pcif1P59114 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pcif1P59114 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pcif1P59114 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pcif1P59114 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms