Protein–RNA interactions for Protein: P58465

Ctdspl, CTD small phosphatase-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtdsplP58465 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtdsplP58465 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtdsplP58465 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtdsplP58465 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtdsplP58465 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtdsplP58465 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtdsplP58465 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtdsplP58465 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtdsplP58465 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtdsplP58465 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtdsplP58465 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtdsplP58465 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtdsplP58465 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtdsplP58465 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtdsplP58465 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtdsplP58465 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtdsplP58465 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CtdsplP58465 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CtdsplP58465 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CtdsplP58465 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CtdsplP58465 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CtdsplP58465 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtdsplP58465 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtdsplP58465 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtdsplP58465 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtdsplP58465 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtdsplP58465 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtdsplP58465 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtdsplP58465 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtdsplP58465 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtdsplP58465 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtdsplP58465 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtdsplP58465 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CtdsplP58465 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CtdsplP58465 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtdsplP58465 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtdsplP58465 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtdsplP58465 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtdsplP58465 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtdsplP58465 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtdsplP58465 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtdsplP58465 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtdsplP58465 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtdsplP58465 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtdsplP58465 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CtdsplP58465 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CtdsplP58465 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtdsplP58465 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtdsplP58465 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CtdsplP58465 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtdsplP58465 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtdsplP58465 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtdsplP58465 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtdsplP58465 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtdsplP58465 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtdsplP58465 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtdsplP58465 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtdsplP58465 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtdsplP58465 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtdsplP58465 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtdsplP58465 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtdsplP58465 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtdsplP58465 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtdsplP58465 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtdsplP58465 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtdsplP58465 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtdsplP58465 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtdsplP58465 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtdsplP58465 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtdsplP58465 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtdsplP58465 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtdsplP58465 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtdsplP58465 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CtdsplP58465 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtdsplP58465 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtdsplP58465 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtdsplP58465 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtdsplP58465 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtdsplP58465 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtdsplP58465 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtdsplP58465 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtdsplP58465 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtdsplP58465 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtdsplP58465 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtdsplP58465 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtdsplP58465 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtdsplP58465 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtdsplP58465 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtdsplP58465 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtdsplP58465 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtdsplP58465 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtdsplP58465 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtdsplP58465 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtdsplP58465 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CtdsplP58465 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtdsplP58465 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtdsplP58465 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtdsplP58465 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtdsplP58465 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtdsplP58465 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms