Protein–RNA interactions for Protein: P56581

Tdg, G/T mismatch-specific thymine DNA glycosylase, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TdgP56581 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TdgP56581 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TdgP56581 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TdgP56581 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TdgP56581 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TdgP56581 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TdgP56581 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TdgP56581 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TdgP56581 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TdgP56581 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TdgP56581 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TdgP56581 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TdgP56581 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TdgP56581 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TdgP56581 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TdgP56581 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TdgP56581 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TdgP56581 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TdgP56581 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TdgP56581 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TdgP56581 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TdgP56581 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TdgP56581 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TdgP56581 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TdgP56581 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TdgP56581 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TdgP56581 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TdgP56581 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TdgP56581 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TdgP56581 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TdgP56581 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TdgP56581 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TdgP56581 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TdgP56581 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TdgP56581 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TdgP56581 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TdgP56581 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TdgP56581 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TdgP56581 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TdgP56581 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TdgP56581 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TdgP56581 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TdgP56581 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TdgP56581 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TdgP56581 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TdgP56581 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TdgP56581 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TdgP56581 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TdgP56581 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TdgP56581 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TdgP56581 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TdgP56581 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TdgP56581 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TdgP56581 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TdgP56581 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TdgP56581 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TdgP56581 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TdgP56581 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TdgP56581 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TdgP56581 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TdgP56581 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TdgP56581 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TdgP56581 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TdgP56581 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TdgP56581 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TdgP56581 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TdgP56581 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TdgP56581 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TdgP56581 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TdgP56581 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TdgP56581 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TdgP56581 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TdgP56581 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TdgP56581 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TdgP56581 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TdgP56581 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TdgP56581 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TdgP56581 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TdgP56581 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TdgP56581 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TdgP56581 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TdgP56581 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TdgP56581 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TdgP56581 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TdgP56581 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TdgP56581 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TdgP56581 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TdgP56581 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
TdgP56581 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TdgP56581 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TdgP56581 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TdgP56581 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
TdgP56581 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TdgP56581 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TdgP56581 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TdgP56581 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TdgP56581 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
TdgP56581 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TdgP56581 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TdgP56581 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms