Protein–RNA interactions for Protein: P56563

Lim2, Lens fiber membrane intrinsic protein, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lim2P56563 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lim2P56563 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lim2P56563 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lim2P56563 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lim2P56563 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lim2P56563 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lim2P56563 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lim2P56563 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lim2P56563 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lim2P56563 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lim2P56563 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lim2P56563 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lim2P56563 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Lim2P56563 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lim2P56563 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Lim2P56563 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Lim2P56563 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lim2P56563 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Lim2P56563 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Lim2P56563 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Lim2P56563 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Lim2P56563 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Lim2P56563 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lim2P56563 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lim2P56563 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Lim2P56563 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lim2P56563 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lim2P56563 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lim2P56563 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lim2P56563 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lim2P56563 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lim2P56563 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lim2P56563 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lim2P56563 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lim2P56563 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lim2P56563 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lim2P56563 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lim2P56563 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lim2P56563 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lim2P56563 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lim2P56563 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lim2P56563 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lim2P56563 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lim2P56563 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Lim2P56563 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lim2P56563 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lim2P56563 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lim2P56563 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lim2P56563 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Lim2P56563 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lim2P56563 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Lim2P56563 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lim2P56563 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Lim2P56563 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lim2P56563 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Lim2P56563 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lim2P56563 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lim2P56563 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lim2P56563 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lim2P56563 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lim2P56563 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lim2P56563 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lim2P56563 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lim2P56563 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lim2P56563 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lim2P56563 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lim2P56563 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lim2P56563 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lim2P56563 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lim2P56563 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lim2P56563 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lim2P56563 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lim2P56563 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lim2P56563 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lim2P56563 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lim2P56563 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Lim2P56563 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lim2P56563 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lim2P56563 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lim2P56563 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lim2P56563 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lim2P56563 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lim2P56563 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lim2P56563 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lim2P56563 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lim2P56563 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lim2P56563 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lim2P56563 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lim2P56563 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Lim2P56563 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lim2P56563 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lim2P56563 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lim2P56563 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lim2P56563 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lim2P56563 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lim2P56563 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lim2P56563 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lim2P56563 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lim2P56563 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lim2P56563 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms