Protein–RNA interactions for Protein: P56546

Ctbp2, C-terminal-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctbp2P56546 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctbp2P56546 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctbp2P56546 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctbp2P56546 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctbp2P56546 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctbp2P56546 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctbp2P56546 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctbp2P56546 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctbp2P56546 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctbp2P56546 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctbp2P56546 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctbp2P56546 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctbp2P56546 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctbp2P56546 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctbp2P56546 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctbp2P56546 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctbp2P56546 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctbp2P56546 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctbp2P56546 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctbp2P56546 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctbp2P56546 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctbp2P56546 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctbp2P56546 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctbp2P56546 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctbp2P56546 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctbp2P56546 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctbp2P56546 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctbp2P56546 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctbp2P56546 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctbp2P56546 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctbp2P56546 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctbp2P56546 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctbp2P56546 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctbp2P56546 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctbp2P56546 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctbp2P56546 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctbp2P56546 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctbp2P56546 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctbp2P56546 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctbp2P56546 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctbp2P56546 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctbp2P56546 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctbp2P56546 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctbp2P56546 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctbp2P56546 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctbp2P56546 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctbp2P56546 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctbp2P56546 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctbp2P56546 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctbp2P56546 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctbp2P56546 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctbp2P56546 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctbp2P56546 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctbp2P56546 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctbp2P56546 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctbp2P56546 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctbp2P56546 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctbp2P56546 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctbp2P56546 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctbp2P56546 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctbp2P56546 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctbp2P56546 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctbp2P56546 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctbp2P56546 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctbp2P56546 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctbp2P56546 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctbp2P56546 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctbp2P56546 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctbp2P56546 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctbp2P56546 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctbp2P56546 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctbp2P56546 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctbp2P56546 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctbp2P56546 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctbp2P56546 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctbp2P56546 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctbp2P56546 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctbp2P56546 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctbp2P56546 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctbp2P56546 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctbp2P56546 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctbp2P56546 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctbp2P56546 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctbp2P56546 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctbp2P56546 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctbp2P56546 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctbp2P56546 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctbp2P56546 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctbp2P56546 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctbp2P56546 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctbp2P56546 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctbp2P56546 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctbp2P56546 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctbp2P56546 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctbp2P56546 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctbp2P56546 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctbp2P56546 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctbp2P56546 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctbp2P56546 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctbp2P56546 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms