Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gp1bbP56400 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gp1bbP56400 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gp1bbP56400 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gp1bbP56400 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Gp1bbP56400 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gp1bbP56400 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Gp1bbP56400 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gp1bbP56400 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Gp1bbP56400 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gp1bbP56400 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gp1bbP56400 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gp1bbP56400 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Gp1bbP56400 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Gp1bbP56400 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Gp1bbP56400 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gp1bbP56400 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gp1bbP56400 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Gp1bbP56400 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Gp1bbP56400 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gp1bbP56400 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gp1bbP56400 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Gp1bbP56400 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Gp1bbP56400 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gp1bbP56400 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gp1bbP56400 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gp1bbP56400 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gp1bbP56400 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gp1bbP56400 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gp1bbP56400 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Gp1bbP56400 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gp1bbP56400 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gp1bbP56400 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gp1bbP56400 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Gp1bbP56400 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Gp1bbP56400 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gp1bbP56400 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gp1bbP56400 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gp1bbP56400 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gp1bbP56400 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gp1bbP56400 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gp1bbP56400 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gp1bbP56400 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gp1bbP56400 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gp1bbP56400 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gp1bbP56400 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gp1bbP56400 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gp1bbP56400 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gp1bbP56400 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gp1bbP56400 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gp1bbP56400 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gp1bbP56400 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gp1bbP56400 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gp1bbP56400 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gp1bbP56400 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gp1bbP56400 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Gp1bbP56400 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gp1bbP56400 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gp1bbP56400 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gp1bbP56400 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gp1bbP56400 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Gp1bbP56400 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gp1bbP56400 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gp1bbP56400 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gp1bbP56400 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Gp1bbP56400 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gp1bbP56400 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gp1bbP56400 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gp1bbP56400 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gp1bbP56400 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gp1bbP56400 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gp1bbP56400 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gp1bbP56400 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gp1bbP56400 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gp1bbP56400 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gp1bbP56400 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gp1bbP56400 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gp1bbP56400 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gp1bbP56400 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gp1bbP56400 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gp1bbP56400 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gp1bbP56400 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gp1bbP56400 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gp1bbP56400 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gp1bbP56400 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gp1bbP56400 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gp1bbP56400 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gp1bbP56400 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gp1bbP56400 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gp1bbP56400 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gp1bbP56400 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gp1bbP56400 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gp1bbP56400 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gp1bbP56400 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gp1bbP56400 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gp1bbP56400 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gp1bbP56400 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gp1bbP56400 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Gp1bbP56400 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gp1bbP56400 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms