Protein–RNA interactions for Protein: P56389

Cda, Cytidine deaminase, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CdaP56389 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CdaP56389 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CdaP56389 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CdaP56389 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CdaP56389 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CdaP56389 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CdaP56389 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CdaP56389 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CdaP56389 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CdaP56389 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CdaP56389 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CdaP56389 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CdaP56389 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CdaP56389 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CdaP56389 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CdaP56389 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CdaP56389 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CdaP56389 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CdaP56389 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CdaP56389 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CdaP56389 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CdaP56389 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CdaP56389 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CdaP56389 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CdaP56389 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CdaP56389 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CdaP56389 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CdaP56389 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CdaP56389 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CdaP56389 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CdaP56389 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CdaP56389 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CdaP56389 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CdaP56389 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CdaP56389 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CdaP56389 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CdaP56389 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CdaP56389 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CdaP56389 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CdaP56389 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CdaP56389 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CdaP56389 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CdaP56389 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CdaP56389 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CdaP56389 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CdaP56389 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CdaP56389 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CdaP56389 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CdaP56389 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CdaP56389 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CdaP56389 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CdaP56389 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CdaP56389 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CdaP56389 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CdaP56389 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CdaP56389 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CdaP56389 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CdaP56389 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CdaP56389 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CdaP56389 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CdaP56389 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CdaP56389 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CdaP56389 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CdaP56389 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CdaP56389 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CdaP56389 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CdaP56389 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CdaP56389 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CdaP56389 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CdaP56389 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CdaP56389 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CdaP56389 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CdaP56389 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CdaP56389 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CdaP56389 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CdaP56389 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CdaP56389 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CdaP56389 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CdaP56389 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CdaP56389 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CdaP56389 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CdaP56389 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CdaP56389 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CdaP56389 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CdaP56389 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CdaP56389 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CdaP56389 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CdaP56389 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CdaP56389 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CdaP56389 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CdaP56389 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CdaP56389 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CdaP56389 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CdaP56389 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CdaP56389 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CdaP56389 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CdaP56389 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CdaP56389 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CdaP56389 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CdaP56389 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms