Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rrp1P56183 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rrp1P56183 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rrp1P56183 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rrp1P56183 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rrp1P56183 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rrp1P56183 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rrp1P56183 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rrp1P56183 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rrp1P56183 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Rrp1P56183 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rrp1P56183 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rrp1P56183 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rrp1P56183 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rrp1P56183 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rrp1P56183 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rrp1P56183 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rrp1P56183 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rrp1P56183 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rrp1P56183 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rrp1P56183 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rrp1P56183 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Rrp1P56183 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Rrp1P56183 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rrp1P56183 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rrp1P56183 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rrp1P56183 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rrp1P56183 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rrp1P56183 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rrp1P56183 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rrp1P56183 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rrp1P56183 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rrp1P56183 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rrp1P56183 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rrp1P56183 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rrp1P56183 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rrp1P56183 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rrp1P56183 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rrp1P56183 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rrp1P56183 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rrp1P56183 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rrp1P56183 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rrp1P56183 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rrp1P56183 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rrp1P56183 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rrp1P56183 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rrp1P56183 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rrp1P56183 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rrp1P56183 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rrp1P56183 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rrp1P56183 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rrp1P56183 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rrp1P56183 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rrp1P56183 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rrp1P56183 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rrp1P56183 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rrp1P56183 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rrp1P56183 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rrp1P56183 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rrp1P56183 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rrp1P56183 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rrp1P56183 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rrp1P56183 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rrp1P56183 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rrp1P56183 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rrp1P56183 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rrp1P56183 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rrp1P56183 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rrp1P56183 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rrp1P56183 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rrp1P56183 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rrp1P56183 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rrp1P56183 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rrp1P56183 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rrp1P56183 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rrp1P56183 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rrp1P56183 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rrp1P56183 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rrp1P56183 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rrp1P56183 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rrp1P56183 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rrp1P56183 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rrp1P56183 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rrp1P56183 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rrp1P56183 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rrp1P56183 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rrp1P56183 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rrp1P56183 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rrp1P56183 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Rrp1P56183 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rrp1P56183 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rrp1P56183 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rrp1P56183 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rrp1P56183 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rrp1P56183 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rrp1P56183 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rrp1P56183 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rrp1P56183 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rrp1P56183 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rrp1P56183 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms