Protein–RNA interactions for Protein: P55098

Pex2, Peroxisome biogenesis factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pex2P55098 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pex2P55098 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pex2P55098 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pex2P55098 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Pex2P55098 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Pex2P55098 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pex2P55098 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pex2P55098 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pex2P55098 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pex2P55098 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pex2P55098 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pex2P55098 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pex2P55098 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pex2P55098 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pex2P55098 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pex2P55098 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pex2P55098 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pex2P55098 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Pex2P55098 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pex2P55098 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pex2P55098 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pex2P55098 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pex2P55098 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pex2P55098 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pex2P55098 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pex2P55098 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pex2P55098 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pex2P55098 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pex2P55098 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pex2P55098 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pex2P55098 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pex2P55098 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pex2P55098 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pex2P55098 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pex2P55098 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pex2P55098 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pex2P55098 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pex2P55098 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pex2P55098 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pex2P55098 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pex2P55098 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pex2P55098 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pex2P55098 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pex2P55098 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pex2P55098 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pex2P55098 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pex2P55098 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pex2P55098 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pex2P55098 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pex2P55098 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pex2P55098 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Pex2P55098 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Pex2P55098 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pex2P55098 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pex2P55098 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pex2P55098 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pex2P55098 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pex2P55098 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pex2P55098 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pex2P55098 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pex2P55098 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Pex2P55098 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pex2P55098 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pex2P55098 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pex2P55098 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pex2P55098 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pex2P55098 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pex2P55098 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pex2P55098 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pex2P55098 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pex2P55098 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pex2P55098 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pex2P55098 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pex2P55098 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pex2P55098 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pex2P55098 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pex2P55098 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pex2P55098 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pex2P55098 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pex2P55098 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pex2P55098 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pex2P55098 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Pex2P55098 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pex2P55098 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pex2P55098 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pex2P55098 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Pex2P55098 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pex2P55098 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pex2P55098 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pex2P55098 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pex2P55098 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pex2P55098 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pex2P55098 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pex2P55098 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pex2P55098 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pex2P55098 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pex2P55098 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pex2P55098 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Pex2P55098 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pex2P55098 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms