Protein–RNA interactions for Protein: P54754

Ephb3, Ephrin type-B receptor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb3P54754 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ephb3P54754 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ephb3P54754 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ephb3P54754 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ephb3P54754 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ephb3P54754 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ephb3P54754 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ephb3P54754 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ephb3P54754 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ephb3P54754 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ephb3P54754 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ephb3P54754 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ephb3P54754 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ephb3P54754 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ephb3P54754 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ephb3P54754 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ephb3P54754 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Ephb3P54754 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Ephb3P54754 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ephb3P54754 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Ephb3P54754 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ephb3P54754 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ephb3P54754 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ephb3P54754 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ephb3P54754 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ephb3P54754 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ephb3P54754 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ephb3P54754 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ephb3P54754 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ephb3P54754 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ephb3P54754 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ephb3P54754 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ephb3P54754 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ephb3P54754 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ephb3P54754 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ephb3P54754 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ephb3P54754 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ephb3P54754 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ephb3P54754 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ephb3P54754 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ephb3P54754 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ephb3P54754 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ephb3P54754 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ephb3P54754 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ephb3P54754 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ephb3P54754 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ephb3P54754 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ephb3P54754 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ephb3P54754 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ephb3P54754 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ephb3P54754 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ephb3P54754 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ephb3P54754 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ephb3P54754 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ephb3P54754 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ephb3P54754 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ephb3P54754 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ephb3P54754 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ephb3P54754 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ephb3P54754 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ephb3P54754 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ephb3P54754 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ephb3P54754 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ephb3P54754 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ephb3P54754 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Ephb3P54754 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Ephb3P54754 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Ephb3P54754 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ephb3P54754 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ephb3P54754 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ephb3P54754 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ephb3P54754 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ephb3P54754 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ephb3P54754 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ephb3P54754 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ephb3P54754 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ephb3P54754 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Ephb3P54754 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ephb3P54754 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ephb3P54754 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ephb3P54754 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ephb3P54754 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ephb3P54754 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Ephb3P54754 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Ephb3P54754 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ephb3P54754 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Ephb3P54754 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Ephb3P54754 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ephb3P54754 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ephb3P54754 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ephb3P54754 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ephb3P54754 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ephb3P54754 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ephb3P54754 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ephb3P54754 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ephb3P54754 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ephb3P54754 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ephb3P54754 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ephb3P54754 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ephb3P54754 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms