Protein–RNA interactions for Protein: P54731

Faf1, FAS-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Faf1P54731 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Faf1P54731 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Faf1P54731 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Faf1P54731 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Faf1P54731 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Faf1P54731 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Faf1P54731 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Faf1P54731 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Faf1P54731 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Faf1P54731 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Faf1P54731 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Faf1P54731 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Faf1P54731 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Faf1P54731 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Faf1P54731 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Faf1P54731 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Faf1P54731 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Faf1P54731 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Faf1P54731 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Faf1P54731 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Faf1P54731 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Faf1P54731 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Faf1P54731 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Faf1P54731 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Faf1P54731 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Faf1P54731 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Faf1P54731 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Faf1P54731 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Faf1P54731 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Faf1P54731 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Faf1P54731 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Faf1P54731 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Faf1P54731 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Faf1P54731 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Faf1P54731 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Faf1P54731 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Faf1P54731 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Faf1P54731 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Faf1P54731 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Faf1P54731 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Faf1P54731 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Faf1P54731 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Faf1P54731 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Faf1P54731 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Faf1P54731 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Faf1P54731 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Faf1P54731 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Faf1P54731 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Faf1P54731 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Faf1P54731 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Faf1P54731 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Faf1P54731 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Faf1P54731 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Faf1P54731 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Faf1P54731 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Faf1P54731 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Faf1P54731 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Faf1P54731 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Faf1P54731 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Faf1P54731 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Faf1P54731 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Faf1P54731 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Faf1P54731 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Faf1P54731 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Faf1P54731 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Faf1P54731 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Faf1P54731 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Faf1P54731 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Faf1P54731 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Faf1P54731 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Faf1P54731 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Faf1P54731 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Faf1P54731 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Faf1P54731 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Faf1P54731 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Faf1P54731 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Faf1P54731 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Faf1P54731 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Faf1P54731 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Faf1P54731 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Faf1P54731 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Faf1P54731 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Faf1P54731 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Faf1P54731 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Faf1P54731 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Faf1P54731 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Faf1P54731 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Faf1P54731 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Faf1P54731 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Faf1P54731 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Faf1P54731 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Faf1P54731 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Faf1P54731 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Faf1P54731 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Faf1P54731 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Faf1P54731 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Faf1P54731 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Faf1P54731 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Faf1P54731 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Faf1P54731 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms