Protein–RNA interactions for Protein: P50571

Gabrb1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrb1P50571 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabrb1P50571 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabrb1P50571 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabrb1P50571 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabrb1P50571 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabrb1P50571 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabrb1P50571 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Gabrb1P50571 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabrb1P50571 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabrb1P50571 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
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Gabrb1P50571 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabrb1P50571 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabrb1P50571 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Gabrb1P50571 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabrb1P50571 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabrb1P50571 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabrb1P50571 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabrb1P50571 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
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Gabrb1P50571 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabrb1P50571 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Gabrb1P50571 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabrb1P50571 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabrb1P50571 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabrb1P50571 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabrb1P50571 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabrb1P50571 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabrb1P50571 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabrb1P50571 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabrb1P50571 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabrb1P50571 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabrb1P50571 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabrb1P50571 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabrb1P50571 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabrb1P50571 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabrb1P50571 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabrb1P50571 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Gabrb1P50571 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gabrb1P50571 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gabrb1P50571 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gabrb1P50571 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gabrb1P50571 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gabrb1P50571 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gabrb1P50571 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Gabrb1P50571 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Gabrb1P50571 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Gabrb1P50571 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gabrb1P50571 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gabrb1P50571 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Gabrb1P50571 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Gabrb1P50571 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Gabrb1P50571 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Gabrb1P50571 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gabrb1P50571 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gabrb1P50571 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Gabrb1P50571 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Gabrb1P50571 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gabrb1P50571 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gabrb1P50571 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gabrb1P50571 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gabrb1P50571 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gabrb1P50571 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gabrb1P50571 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gabrb1P50571 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabrb1P50571 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabrb1P50571 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabrb1P50571 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabrb1P50571 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabrb1P50571 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabrb1P50571 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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