Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtpreP49446 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtpreP49446 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtpreP49446 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtpreP49446 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtpreP49446 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtpreP49446 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtpreP49446 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtpreP49446 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtpreP49446 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtpreP49446 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtpreP49446 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PtpreP49446 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PtpreP49446 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PtpreP49446 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PtpreP49446 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PtpreP49446 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PtpreP49446 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PtpreP49446 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PtpreP49446 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PtpreP49446 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PtpreP49446 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtpreP49446 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtpreP49446 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtpreP49446 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtpreP49446 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtpreP49446 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtpreP49446 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtpreP49446 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtpreP49446 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtpreP49446 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtpreP49446 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtpreP49446 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtpreP49446 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtpreP49446 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtpreP49446 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtpreP49446 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtpreP49446 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtpreP49446 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtpreP49446 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtpreP49446 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtpreP49446 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtpreP49446 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtpreP49446 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtpreP49446 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtpreP49446 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtpreP49446 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtpreP49446 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtpreP49446 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtpreP49446 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtpreP49446 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtpreP49446 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtpreP49446 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtpreP49446 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtpreP49446 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PtpreP49446 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtpreP49446 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtpreP49446 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtpreP49446 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtpreP49446 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtpreP49446 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PtpreP49446 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtpreP49446 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtpreP49446 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtpreP49446 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtpreP49446 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PtpreP49446 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtpreP49446 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtpreP49446 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtpreP49446 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtpreP49446 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PtpreP49446 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
PtpreP49446 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PtpreP49446 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PtpreP49446 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PtpreP49446 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PtpreP49446 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PtpreP49446 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtpreP49446 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PtpreP49446 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtpreP49446 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtpreP49446 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtpreP49446 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PtpreP49446 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PtpreP49446 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PtpreP49446 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PtpreP49446 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PtpreP49446 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PtpreP49446 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PtpreP49446 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PtpreP49446 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PtpreP49446 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
PtpreP49446 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PtpreP49446 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PtpreP49446 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PtpreP49446 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PtpreP49446 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PtpreP49446 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PtpreP49446 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PtpreP49446 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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