Protein–RNA interactions for Protein: P49194

Rbp3, Retinol-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp3P49194 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rbp3P49194 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Rbp3P49194 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rbp3P49194 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rbp3P49194 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rbp3P49194 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Rbp3P49194 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Rbp3P49194 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rbp3P49194 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rbp3P49194 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Rbp3P49194 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rbp3P49194 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rbp3P49194 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Rbp3P49194 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rbp3P49194 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Rbp3P49194 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rbp3P49194 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rbp3P49194 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rbp3P49194 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rbp3P49194 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rbp3P49194 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rbp3P49194 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rbp3P49194 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rbp3P49194 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rbp3P49194 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rbp3P49194 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rbp3P49194 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rbp3P49194 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rbp3P49194 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rbp3P49194 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rbp3P49194 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rbp3P49194 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rbp3P49194 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rbp3P49194 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rbp3P49194 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rbp3P49194 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rbp3P49194 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rbp3P49194 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rbp3P49194 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rbp3P49194 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rbp3P49194 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rbp3P49194 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rbp3P49194 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rbp3P49194 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rbp3P49194 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rbp3P49194 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rbp3P49194 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rbp3P49194 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Rbp3P49194 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rbp3P49194 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rbp3P49194 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rbp3P49194 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rbp3P49194 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Rbp3P49194 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rbp3P49194 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rbp3P49194 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rbp3P49194 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rbp3P49194 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rbp3P49194 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rbp3P49194 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rbp3P49194 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rbp3P49194 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rbp3P49194 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rbp3P49194 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Rbp3P49194 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rbp3P49194 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rbp3P49194 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rbp3P49194 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rbp3P49194 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rbp3P49194 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rbp3P49194 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.79
Rbp3P49194 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rbp3P49194 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rbp3P49194 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rbp3P49194 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rbp3P49194 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rbp3P49194 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rbp3P49194 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Rbp3P49194 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rbp3P49194 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rbp3P49194 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rbp3P49194 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rbp3P49194 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rbp3P49194 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rbp3P49194 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rbp3P49194 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rbp3P49194 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rbp3P49194 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rbp3P49194 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rbp3P49194 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rbp3P49194 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rbp3P49194 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rbp3P49194 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rbp3P49194 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rbp3P49194 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rbp3P49194 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rbp3P49194 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rbp3P49194 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rbp3P49194 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rbp3P49194 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms