Protein–RNA interactions for Protein: P48759

Ptx3, Pentraxin-related protein PTX3, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx3P48759 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptx3P48759 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptx3P48759 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptx3P48759 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptx3P48759 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptx3P48759 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptx3P48759 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptx3P48759 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptx3P48759 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptx3P48759 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptx3P48759 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptx3P48759 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptx3P48759 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptx3P48759 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ptx3P48759 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ptx3P48759 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ptx3P48759 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ptx3P48759 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ptx3P48759 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ptx3P48759 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ptx3P48759 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ptx3P48759 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ptx3P48759 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ptx3P48759 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ptx3P48759 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ptx3P48759 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ptx3P48759 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ptx3P48759 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ptx3P48759 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ptx3P48759 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ptx3P48759 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ptx3P48759 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ptx3P48759 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ptx3P48759 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ptx3P48759 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ptx3P48759 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ptx3P48759 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ptx3P48759 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ptx3P48759 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ptx3P48759 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ptx3P48759 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ptx3P48759 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ptx3P48759 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ptx3P48759 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ptx3P48759 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ptx3P48759 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ptx3P48759 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ptx3P48759 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ptx3P48759 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ptx3P48759 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ptx3P48759 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ptx3P48759 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ptx3P48759 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ptx3P48759 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ptx3P48759 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ptx3P48759 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ptx3P48759 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ptx3P48759 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ptx3P48759 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ptx3P48759 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ptx3P48759 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ptx3P48759 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptx3P48759 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptx3P48759 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptx3P48759 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptx3P48759 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptx3P48759 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptx3P48759 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptx3P48759 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptx3P48759 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptx3P48759 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptx3P48759 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptx3P48759 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptx3P48759 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptx3P48759 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptx3P48759 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptx3P48759 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptx3P48759 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptx3P48759 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptx3P48759 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptx3P48759 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptx3P48759 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptx3P48759 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptx3P48759 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptx3P48759 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptx3P48759 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptx3P48759 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptx3P48759 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptx3P48759 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptx3P48759 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptx3P48759 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptx3P48759 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptx3P48759 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptx3P48759 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptx3P48759 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptx3P48759 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptx3P48759 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptx3P48759 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptx3P48759 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptx3P48759 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms