Protein–RNA interactions for Protein: P48432

Sox2, Transcription factor SOX-2, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox2P48432 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sox2P48432 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sox2P48432 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sox2P48432 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sox2P48432 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sox2P48432 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sox2P48432 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sox2P48432 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sox2P48432 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sox2P48432 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sox2P48432 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sox2P48432 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sox2P48432 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sox2P48432 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sox2P48432 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sox2P48432 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sox2P48432 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sox2P48432 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sox2P48432 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sox2P48432 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Sox2P48432 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sox2P48432 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Sox2P48432 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Sox2P48432 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Sox2P48432 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sox2P48432 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sox2P48432 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sox2P48432 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sox2P48432 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sox2P48432 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sox2P48432 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sox2P48432 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sox2P48432 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sox2P48432 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sox2P48432 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sox2P48432 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Sox2P48432 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sox2P48432 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sox2P48432 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sox2P48432 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sox2P48432 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sox2P48432 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sox2P48432 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sox2P48432 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sox2P48432 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sox2P48432 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sox2P48432 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sox2P48432 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Sox2P48432 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sox2P48432 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sox2P48432 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sox2P48432 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sox2P48432 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sox2P48432 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sox2P48432 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sox2P48432 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sox2P48432 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sox2P48432 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox2P48432 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox2P48432 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox2P48432 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox2P48432 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox2P48432 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox2P48432 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox2P48432 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox2P48432 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox2P48432 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox2P48432 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox2P48432 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox2P48432 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox2P48432 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox2P48432 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox2P48432 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox2P48432 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox2P48432 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox2P48432 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox2P48432 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox2P48432 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox2P48432 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox2P48432 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox2P48432 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox2P48432 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox2P48432 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox2P48432 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox2P48432 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox2P48432 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox2P48432 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox2P48432 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox2P48432 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox2P48432 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox2P48432 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox2P48432 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox2P48432 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox2P48432 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sox2P48432 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sox2P48432 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sox2P48432 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sox2P48432 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sox2P48432 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sox2P48432 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms