Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VdrP48281 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
VdrP48281 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VdrP48281 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VdrP48281 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VdrP48281 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VdrP48281 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VdrP48281 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VdrP48281 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VdrP48281 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VdrP48281 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VdrP48281 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VdrP48281 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VdrP48281 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VdrP48281 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VdrP48281 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VdrP48281 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VdrP48281 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VdrP48281 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VdrP48281 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VdrP48281 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VdrP48281 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VdrP48281 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VdrP48281 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VdrP48281 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VdrP48281 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VdrP48281 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VdrP48281 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VdrP48281 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VdrP48281 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VdrP48281 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VdrP48281 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
VdrP48281 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VdrP48281 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VdrP48281 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VdrP48281 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VdrP48281 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VdrP48281 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VdrP48281 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VdrP48281 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VdrP48281 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
VdrP48281 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VdrP48281 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VdrP48281 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VdrP48281 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
VdrP48281 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VdrP48281 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VdrP48281 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
VdrP48281 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
VdrP48281 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
VdrP48281 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VdrP48281 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VdrP48281 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VdrP48281 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VdrP48281 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VdrP48281 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VdrP48281 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VdrP48281 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VdrP48281 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VdrP48281 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VdrP48281 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VdrP48281 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VdrP48281 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VdrP48281 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VdrP48281 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VdrP48281 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VdrP48281 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VdrP48281 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VdrP48281 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VdrP48281 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VdrP48281 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VdrP48281 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VdrP48281 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
VdrP48281 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
VdrP48281 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VdrP48281 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VdrP48281 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VdrP48281 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VdrP48281 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VdrP48281 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VdrP48281 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VdrP48281 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VdrP48281 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VdrP48281 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VdrP48281 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VdrP48281 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VdrP48281 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
VdrP48281 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VdrP48281 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VdrP48281 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VdrP48281 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VdrP48281 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VdrP48281 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VdrP48281 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VdrP48281 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VdrP48281 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VdrP48281 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VdrP48281 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VdrP48281 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VdrP48281 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms