Protein–RNA interactions for Protein: P47242

Pax9, Paired box protein Pax-9, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax9P47242 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pax9P47242 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pax9P47242 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pax9P47242 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pax9P47242 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pax9P47242 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pax9P47242 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pax9P47242 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pax9P47242 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pax9P47242 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pax9P47242 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pax9P47242 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pax9P47242 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pax9P47242 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pax9P47242 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pax9P47242 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pax9P47242 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pax9P47242 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pax9P47242 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pax9P47242 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pax9P47242 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pax9P47242 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pax9P47242 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pax9P47242 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pax9P47242 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pax9P47242 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pax9P47242 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pax9P47242 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pax9P47242 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pax9P47242 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pax9P47242 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pax9P47242 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pax9P47242 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pax9P47242 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pax9P47242 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pax9P47242 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pax9P47242 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pax9P47242 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pax9P47242 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pax9P47242 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pax9P47242 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pax9P47242 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pax9P47242 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pax9P47242 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pax9P47242 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pax9P47242 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pax9P47242 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pax9P47242 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pax9P47242 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pax9P47242 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pax9P47242 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pax9P47242 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pax9P47242 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pax9P47242 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pax9P47242 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pax9P47242 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pax9P47242 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pax9P47242 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pax9P47242 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pax9P47242 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pax9P47242 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pax9P47242 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pax9P47242 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pax9P47242 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pax9P47242 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pax9P47242 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pax9P47242 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pax9P47242 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pax9P47242 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pax9P47242 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pax9P47242 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pax9P47242 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pax9P47242 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pax9P47242 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pax9P47242 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pax9P47242 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pax9P47242 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pax9P47242 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pax9P47242 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pax9P47242 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pax9P47242 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pax9P47242 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pax9P47242 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pax9P47242 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pax9P47242 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pax9P47242 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pax9P47242 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pax9P47242 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pax9P47242 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pax9P47242 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pax9P47242 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pax9P47242 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pax9P47242 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pax9P47242 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pax9P47242 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pax9P47242 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pax9P47242 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pax9P47242 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pax9P47242 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pax9P47242 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms