Protein–RNA interactions for Protein: P47226

Tes, Testin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TesP47226 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TesP47226 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TesP47226 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TesP47226 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TesP47226 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TesP47226 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TesP47226 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TesP47226 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TesP47226 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TesP47226 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TesP47226 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TesP47226 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TesP47226 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TesP47226 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TesP47226 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TesP47226 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TesP47226 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TesP47226 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TesP47226 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TesP47226 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TesP47226 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TesP47226 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TesP47226 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TesP47226 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TesP47226 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TesP47226 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TesP47226 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TesP47226 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TesP47226 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TesP47226 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TesP47226 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TesP47226 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TesP47226 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TesP47226 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TesP47226 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TesP47226 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TesP47226 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TesP47226 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TesP47226 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TesP47226 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TesP47226 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TesP47226 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TesP47226 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TesP47226 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TesP47226 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TesP47226 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TesP47226 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TesP47226 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TesP47226 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TesP47226 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TesP47226 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TesP47226 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TesP47226 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TesP47226 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TesP47226 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TesP47226 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TesP47226 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TesP47226 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TesP47226 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TesP47226 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TesP47226 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TesP47226 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TesP47226 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TesP47226 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TesP47226 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TesP47226 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TesP47226 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TesP47226 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TesP47226 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TesP47226 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TesP47226 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TesP47226 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TesP47226 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TesP47226 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TesP47226 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TesP47226 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TesP47226 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TesP47226 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TesP47226 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TesP47226 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TesP47226 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TesP47226 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TesP47226 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TesP47226 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TesP47226 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TesP47226 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TesP47226 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TesP47226 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TesP47226 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TesP47226 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TesP47226 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TesP47226 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TesP47226 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TesP47226 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TesP47226 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TesP47226 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TesP47226 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
TesP47226 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
TesP47226 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
TesP47226 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms