Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rab11bP46638 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rab11bP46638 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rab11bP46638 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab11bP46638 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab11bP46638 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab11bP46638 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab11bP46638 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab11bP46638 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab11bP46638 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab11bP46638 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab11bP46638 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab11bP46638 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab11bP46638 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab11bP46638 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab11bP46638 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab11bP46638 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab11bP46638 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab11bP46638 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab11bP46638 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab11bP46638 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab11bP46638 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab11bP46638 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab11bP46638 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab11bP46638 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab11bP46638 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab11bP46638 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab11bP46638 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab11bP46638 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab11bP46638 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab11bP46638 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab11bP46638 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab11bP46638 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab11bP46638 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab11bP46638 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab11bP46638 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab11bP46638 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms