Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nkx1-2P42580 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nkx1-2P42580 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nkx1-2P42580 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nkx1-2P42580 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nkx1-2P42580 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nkx1-2P42580 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nkx1-2P42580 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nkx1-2P42580 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Nkx1-2P42580 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nkx1-2P42580 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nkx1-2P42580 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nkx1-2P42580 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nkx1-2P42580 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nkx1-2P42580 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nkx1-2P42580 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nkx1-2P42580 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nkx1-2P42580 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nkx1-2P42580 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nkx1-2P42580 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nkx1-2P42580 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nkx1-2P42580 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nkx1-2P42580 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nkx1-2P42580 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nkx1-2P42580 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nkx1-2P42580 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nkx1-2P42580 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nkx1-2P42580 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Nkx1-2P42580 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nkx1-2P42580 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nkx1-2P42580 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nkx1-2P42580 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nkx1-2P42580 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nkx1-2P42580 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nkx1-2P42580 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nkx1-2P42580 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nkx1-2P42580 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nkx1-2P42580 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nkx1-2P42580 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nkx1-2P42580 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nkx1-2P42580 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nkx1-2P42580 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nkx1-2P42580 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nkx1-2P42580 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nkx1-2P42580 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Nkx1-2P42580 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nkx1-2P42580 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nkx1-2P42580 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nkx1-2P42580 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nkx1-2P42580 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nkx1-2P42580 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nkx1-2P42580 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nkx1-2P42580 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nkx1-2P42580 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nkx1-2P42580 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nkx1-2P42580 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nkx1-2P42580 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nkx1-2P42580 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nkx1-2P42580 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Nkx1-2P42580 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nkx1-2P42580 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nkx1-2P42580 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nkx1-2P42580 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nkx1-2P42580 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nkx1-2P42580 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nkx1-2P42580 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nkx1-2P42580 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Nkx1-2P42580 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nkx1-2P42580 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nkx1-2P42580 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nkx1-2P42580 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nkx1-2P42580 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nkx1-2P42580 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nkx1-2P42580 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nkx1-2P42580 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nkx1-2P42580 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nkx1-2P42580 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nkx1-2P42580 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nkx1-2P42580 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nkx1-2P42580 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nkx1-2P42580 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nkx1-2P42580 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nkx1-2P42580 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nkx1-2P42580 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nkx1-2P42580 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nkx1-2P42580 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nkx1-2P42580 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nkx1-2P42580 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nkx1-2P42580 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nkx1-2P42580 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nkx1-2P42580 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nkx1-2P42580 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nkx1-2P42580 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nkx1-2P42580 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Nkx1-2P42580 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nkx1-2P42580 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nkx1-2P42580 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nkx1-2P42580 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nkx1-2P42580 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nkx1-2P42580 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms