Protein–RNA interactions for Protein: P41969

Elk1, ETS domain-containing protein Elk-1, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elk1P41969 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Elk1P41969 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Elk1P41969 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Elk1P41969 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Elk1P41969 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Elk1P41969 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Elk1P41969 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Elk1P41969 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Elk1P41969 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Elk1P41969 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Elk1P41969 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Elk1P41969 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Elk1P41969 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Elk1P41969 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Elk1P41969 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Elk1P41969 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Elk1P41969 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Elk1P41969 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Elk1P41969 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Elk1P41969 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Elk1P41969 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Elk1P41969 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Elk1P41969 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Elk1P41969 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Elk1P41969 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Elk1P41969 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Elk1P41969 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Elk1P41969 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Elk1P41969 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Elk1P41969 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Elk1P41969 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Elk1P41969 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Elk1P41969 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Elk1P41969 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Elk1P41969 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Elk1P41969 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Elk1P41969 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Elk1P41969 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Elk1P41969 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Elk1P41969 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Elk1P41969 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Elk1P41969 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Elk1P41969 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Elk1P41969 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Elk1P41969 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Elk1P41969 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Elk1P41969 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Elk1P41969 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Elk1P41969 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Elk1P41969 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Elk1P41969 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Elk1P41969 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Elk1P41969 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Elk1P41969 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Elk1P41969 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Elk1P41969 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Elk1P41969 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Elk1P41969 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Elk1P41969 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Elk1P41969 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Elk1P41969 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Elk1P41969 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Elk1P41969 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Elk1P41969 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Elk1P41969 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Elk1P41969 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Elk1P41969 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Elk1P41969 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Elk1P41969 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Elk1P41969 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Elk1P41969 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Elk1P41969 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Elk1P41969 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Elk1P41969 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Elk1P41969 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Elk1P41969 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Elk1P41969 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Elk1P41969 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Elk1P41969 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Elk1P41969 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Elk1P41969 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Elk1P41969 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Elk1P41969 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Elk1P41969 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Elk1P41969 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Elk1P41969 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Elk1P41969 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Elk1P41969 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Elk1P41969 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Elk1P41969 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Elk1P41969 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Elk1P41969 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Elk1P41969 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Elk1P41969 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Elk1P41969 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Elk1P41969 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Elk1P41969 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Elk1P41969 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Elk1P41969 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Elk1P41969 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms