Protein–RNA interactions for Protein: P40223

Csf3r, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf3rP40223 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Csf3rP40223 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Csf3rP40223 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Csf3rP40223 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Csf3rP40223 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Csf3rP40223 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Csf3rP40223 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Csf3rP40223 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Csf3rP40223 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Csf3rP40223 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Csf3rP40223 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Csf3rP40223 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Csf3rP40223 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Csf3rP40223 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Csf3rP40223 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Csf3rP40223 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Csf3rP40223 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Csf3rP40223 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Csf3rP40223 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Csf3rP40223 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Csf3rP40223 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Csf3rP40223 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Csf3rP40223 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Csf3rP40223 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Csf3rP40223 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Csf3rP40223 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Csf3rP40223 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Csf3rP40223 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Csf3rP40223 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Csf3rP40223 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Csf3rP40223 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Csf3rP40223 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Csf3rP40223 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Csf3rP40223 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Csf3rP40223 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Csf3rP40223 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Csf3rP40223 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Csf3rP40223 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Csf3rP40223 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Csf3rP40223 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Csf3rP40223 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Csf3rP40223 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Csf3rP40223 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Csf3rP40223 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Csf3rP40223 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms