Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Lig1P37913 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lig1P37913 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lig1P37913 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lig1P37913 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lig1P37913 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lig1P37913 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Lig1P37913 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Lig1P37913 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lig1P37913 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lig1P37913 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lig1P37913 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lig1P37913 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lig1P37913 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lig1P37913 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Lig1P37913 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lig1P37913 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lig1P37913 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lig1P37913 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lig1P37913 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lig1P37913 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lig1P37913 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Lig1P37913 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lig1P37913 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lig1P37913 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lig1P37913 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lig1P37913 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lig1P37913 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lig1P37913 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lig1P37913 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lig1P37913 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lig1P37913 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lig1P37913 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lig1P37913 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lig1P37913 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lig1P37913 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lig1P37913 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lig1P37913 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Lig1P37913 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lig1P37913 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lig1P37913 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Lig1P37913 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lig1P37913 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lig1P37913 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lig1P37913 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lig1P37913 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lig1P37913 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lig1P37913 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Lig1P37913 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lig1P37913 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Lig1P37913 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lig1P37913 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lig1P37913 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lig1P37913 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lig1P37913 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Lig1P37913 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lig1P37913 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lig1P37913 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lig1P37913 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lig1P37913 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lig1P37913 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lig1P37913 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lig1P37913 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lig1P37913 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lig1P37913 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lig1P37913 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lig1P37913 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lig1P37913 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lig1P37913 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lig1P37913 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lig1P37913 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lig1P37913 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lig1P37913 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lig1P37913 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lig1P37913 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lig1P37913 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lig1P37913 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lig1P37913 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lig1P37913 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lig1P37913 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lig1P37913 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lig1P37913 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lig1P37913 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lig1P37913 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lig1P37913 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lig1P37913 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lig1P37913 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lig1P37913 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lig1P37913 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lig1P37913 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lig1P37913 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Lig1P37913 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lig1P37913 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Lig1P37913 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lig1P37913 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lig1P37913 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lig1P37913 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lig1P37913 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Lig1P37913 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Lig1P37913 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms