Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ddit3P35639 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ddit3P35639 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ddit3P35639 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ddit3P35639 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ddit3P35639 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ddit3P35639 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ddit3P35639 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ddit3P35639 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ddit3P35639 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ddit3P35639 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ddit3P35639 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ddit3P35639 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ddit3P35639 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ddit3P35639 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ddit3P35639 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ddit3P35639 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ddit3P35639 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ddit3P35639 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ddit3P35639 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ddit3P35639 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ddit3P35639 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ddit3P35639 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ddit3P35639 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ddit3P35639 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ddit3P35639 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ddit3P35639 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ddit3P35639 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ddit3P35639 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ddit3P35639 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ddit3P35639 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ddit3P35639 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ddit3P35639 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ddit3P35639 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ddit3P35639 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ddit3P35639 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ddit3P35639 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ddit3P35639 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ddit3P35639 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ddit3P35639 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ddit3P35639 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ddit3P35639 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ddit3P35639 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ddit3P35639 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ddit3P35639 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ddit3P35639 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ddit3P35639 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ddit3P35639 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ddit3P35639 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ddit3P35639 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ddit3P35639 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ddit3P35639 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ddit3P35639 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ddit3P35639 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ddit3P35639 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ddit3P35639 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ddit3P35639 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ddit3P35639 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ddit3P35639 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ddit3P35639 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ddit3P35639 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ddit3P35639 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ddit3P35639 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ddit3P35639 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ddit3P35639 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ddit3P35639 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ddit3P35639 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ddit3P35639 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ddit3P35639 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ddit3P35639 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ddit3P35639 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ddit3P35639 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ddit3P35639 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ddit3P35639 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ddit3P35639 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ddit3P35639 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ddit3P35639 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ddit3P35639 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ddit3P35639 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ddit3P35639 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ddit3P35639 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ddit3P35639 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ddit3P35639 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ddit3P35639 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ddit3P35639 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ddit3P35639 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ddit3P35639 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ddit3P35639 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ddit3P35639 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ddit3P35639 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ddit3P35639 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ddit3P35639 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ddit3P35639 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ddit3P35639 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ddit3P35639 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ddit3P35639 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ddit3P35639 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ddit3P35639 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ddit3P35639 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ddit3P35639 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms