Protein–RNA interactions for Protein: P35419

Tpo, Thyroid peroxidase, mousemouse

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TpoP35419 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TpoP35419 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TpoP35419 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TpoP35419 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TpoP35419 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TpoP35419 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TpoP35419 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TpoP35419 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TpoP35419 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TpoP35419 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TpoP35419 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TpoP35419 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TpoP35419 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TpoP35419 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TpoP35419 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TpoP35419 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TpoP35419 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TpoP35419 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TpoP35419 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TpoP35419 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TpoP35419 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TpoP35419 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TpoP35419 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TpoP35419 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TpoP35419 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TpoP35419 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TpoP35419 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TpoP35419 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TpoP35419 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TpoP35419 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TpoP35419 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TpoP35419 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TpoP35419 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TpoP35419 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TpoP35419 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TpoP35419 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TpoP35419 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TpoP35419 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TpoP35419 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TpoP35419 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TpoP35419 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TpoP35419 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TpoP35419 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TpoP35419 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TpoP35419 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TpoP35419 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TpoP35419 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TpoP35419 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TpoP35419 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TpoP35419 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TpoP35419 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TpoP35419 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TpoP35419 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TpoP35419 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TpoP35419 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TpoP35419 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TpoP35419 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TpoP35419 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TpoP35419 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TpoP35419 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TpoP35419 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TpoP35419 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TpoP35419 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TpoP35419 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TpoP35419 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TpoP35419 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TpoP35419 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TpoP35419 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TpoP35419 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TpoP35419 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TpoP35419 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TpoP35419 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TpoP35419 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TpoP35419 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TpoP35419 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TpoP35419 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TpoP35419 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TpoP35419 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TpoP35419 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TpoP35419 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TpoP35419 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TpoP35419 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TpoP35419 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TpoP35419 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TpoP35419 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TpoP35419 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TpoP35419 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TpoP35419 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TpoP35419 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TpoP35419 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TpoP35419 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TpoP35419 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TpoP35419 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TpoP35419 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TpoP35419 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TpoP35419 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TpoP35419 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TpoP35419 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TpoP35419 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TpoP35419 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms