Protein–RNA interactions for Protein: P35292

Rab17, Ras-related protein Rab-17, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab17P35292 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab17P35292 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab17P35292 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab17P35292 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab17P35292 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab17P35292 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab17P35292 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab17P35292 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab17P35292 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab17P35292 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab17P35292 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab17P35292 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab17P35292 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab17P35292 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab17P35292 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab17P35292 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab17P35292 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab17P35292 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab17P35292 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab17P35292 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab17P35292 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab17P35292 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab17P35292 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab17P35292 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab17P35292 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab17P35292 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab17P35292 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab17P35292 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab17P35292 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab17P35292 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab17P35292 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab17P35292 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab17P35292 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab17P35292 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab17P35292 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab17P35292 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab17P35292 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab17P35292 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab17P35292 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab17P35292 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab17P35292 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab17P35292 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab17P35292 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab17P35292 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab17P35292 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab17P35292 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab17P35292 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab17P35292 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rab17P35292 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rab17P35292 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rab17P35292 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rab17P35292 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab17P35292 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab17P35292 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab17P35292 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab17P35292 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab17P35292 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab17P35292 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab17P35292 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab17P35292 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab17P35292 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab17P35292 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab17P35292 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab17P35292 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab17P35292 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab17P35292 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab17P35292 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab17P35292 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab17P35292 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab17P35292 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab17P35292 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab17P35292 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Rab17P35292 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab17P35292 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab17P35292 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab17P35292 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab17P35292 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab17P35292 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab17P35292 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab17P35292 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rab17P35292 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab17P35292 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab17P35292 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab17P35292 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab17P35292 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab17P35292 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab17P35292 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab17P35292 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab17P35292 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab17P35292 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab17P35292 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab17P35292 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab17P35292 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab17P35292 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab17P35292 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab17P35292 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab17P35292 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab17P35292 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab17P35292 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab17P35292 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms