Protein–RNA interactions for Protein: P35279

Rab6a, Ras-related protein Rab-6A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab6aP35279 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms