Protein–RNA interactions for Protein: P35278

Rab5c, Ras-related protein Rab-5C, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5cP35278 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab5cP35278 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab5cP35278 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab5cP35278 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab5cP35278 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab5cP35278 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab5cP35278 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab5cP35278 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab5cP35278 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab5cP35278 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab5cP35278 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab5cP35278 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab5cP35278 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab5cP35278 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab5cP35278 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab5cP35278 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab5cP35278 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab5cP35278 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rab5cP35278 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rab5cP35278 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rab5cP35278 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rab5cP35278 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rab5cP35278 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rab5cP35278 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rab5cP35278 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rab5cP35278 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rab5cP35278 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rab5cP35278 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rab5cP35278 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rab5cP35278 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rab5cP35278 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rab5cP35278 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rab5cP35278 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rab5cP35278 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rab5cP35278 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab5cP35278 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab5cP35278 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Rab5cP35278 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab5cP35278 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab5cP35278 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab5cP35278 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab5cP35278 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab5cP35278 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Rab5cP35278 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab5cP35278 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab5cP35278 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab5cP35278 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab5cP35278 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab5cP35278 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Rab5cP35278 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Rab5cP35278 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab5cP35278 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab5cP35278 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab5cP35278 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Rab5cP35278 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Rab5cP35278 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Rab5cP35278 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab5cP35278 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Rab5cP35278 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Rab5cP35278 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Rab5cP35278 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab5cP35278 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Rab5cP35278 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab5cP35278 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab5cP35278 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab5cP35278 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab5cP35278 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab5cP35278 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab5cP35278 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab5cP35278 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Rab5cP35278 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Rab5cP35278 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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