Protein–RNA interactions for Protein: P35175

Stfa1, Stefin-1, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stfa1P35175 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stfa1P35175 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stfa1P35175 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stfa1P35175 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stfa1P35175 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stfa1P35175 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stfa1P35175 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Stfa1P35175 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stfa1P35175 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stfa1P35175 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stfa1P35175 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stfa1P35175 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stfa1P35175 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stfa1P35175 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stfa1P35175 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stfa1P35175 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stfa1P35175 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stfa1P35175 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Stfa1P35175 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stfa1P35175 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stfa1P35175 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stfa1P35175 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stfa1P35175 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stfa1P35175 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stfa1P35175 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stfa1P35175 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stfa1P35175 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stfa1P35175 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stfa1P35175 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stfa1P35175 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stfa1P35175 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stfa1P35175 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stfa1P35175 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stfa1P35175 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stfa1P35175 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stfa1P35175 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stfa1P35175 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stfa1P35175 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stfa1P35175 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stfa1P35175 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stfa1P35175 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stfa1P35175 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stfa1P35175 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Stfa1P35175 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stfa1P35175 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stfa1P35175 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stfa1P35175 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stfa1P35175 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stfa1P35175 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stfa1P35175 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stfa1P35175 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stfa1P35175 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stfa1P35175 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Stfa1P35175 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Stfa1P35175 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stfa1P35175 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Stfa1P35175 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stfa1P35175 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stfa1P35175 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Stfa1P35175 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stfa1P35175 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stfa1P35175 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Stfa1P35175 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Stfa1P35175 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Stfa1P35175 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Stfa1P35175 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stfa1P35175 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Stfa1P35175 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stfa1P35175 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stfa1P35175 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stfa1P35175 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Stfa1P35175 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Stfa1P35175 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stfa1P35175 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stfa1P35175 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Stfa1P35175 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stfa1P35175 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stfa1P35175 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Stfa1P35175 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stfa1P35175 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stfa1P35175 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stfa1P35175 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stfa1P35175 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Stfa1P35175 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Stfa1P35175 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Stfa1P35175 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Stfa1P35175 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stfa1P35175 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stfa1P35175 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stfa1P35175 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Stfa1P35175 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stfa1P35175 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stfa1P35175 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stfa1P35175 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stfa1P35175 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stfa1P35175 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stfa1P35175 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stfa1P35175 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stfa1P35175 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stfa1P35175 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms