Protein–RNA interactions for Protein: P35173

Stfa3, Stefin-3, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stfa3P35173 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stfa3P35173 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stfa3P35173 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stfa3P35173 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stfa3P35173 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stfa3P35173 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stfa3P35173 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stfa3P35173 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stfa3P35173 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stfa3P35173 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stfa3P35173 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stfa3P35173 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stfa3P35173 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stfa3P35173 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stfa3P35173 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stfa3P35173 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stfa3P35173 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stfa3P35173 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stfa3P35173 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stfa3P35173 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stfa3P35173 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stfa3P35173 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stfa3P35173 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stfa3P35173 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stfa3P35173 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stfa3P35173 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stfa3P35173 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stfa3P35173 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stfa3P35173 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Stfa3P35173 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stfa3P35173 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stfa3P35173 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stfa3P35173 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stfa3P35173 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Stfa3P35173 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stfa3P35173 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stfa3P35173 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stfa3P35173 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stfa3P35173 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stfa3P35173 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stfa3P35173 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stfa3P35173 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stfa3P35173 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stfa3P35173 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stfa3P35173 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stfa3P35173 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stfa3P35173 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Stfa3P35173 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stfa3P35173 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stfa3P35173 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stfa3P35173 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stfa3P35173 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stfa3P35173 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Stfa3P35173 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stfa3P35173 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Stfa3P35173 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stfa3P35173 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Stfa3P35173 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Stfa3P35173 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stfa3P35173 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Stfa3P35173 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Stfa3P35173 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Stfa3P35173 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Stfa3P35173 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stfa3P35173 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stfa3P35173 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stfa3P35173 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stfa3P35173 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stfa3P35173 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stfa3P35173 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stfa3P35173 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stfa3P35173 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stfa3P35173 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stfa3P35173 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stfa3P35173 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stfa3P35173 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stfa3P35173 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stfa3P35173 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stfa3P35173 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stfa3P35173 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stfa3P35173 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stfa3P35173 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stfa3P35173 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Stfa3P35173 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stfa3P35173 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Stfa3P35173 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stfa3P35173 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stfa3P35173 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stfa3P35173 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stfa3P35173 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stfa3P35173 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Stfa3P35173 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stfa3P35173 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stfa3P35173 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stfa3P35173 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stfa3P35173 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stfa3P35173 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stfa3P35173 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stfa3P35173 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stfa3P35173 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms