Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apoc1P34928 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apoc1P34928 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apoc1P34928 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apoc1P34928 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apoc1P34928 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apoc1P34928 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apoc1P34928 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Apoc1P34928 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apoc1P34928 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apoc1P34928 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apoc1P34928 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apoc1P34928 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apoc1P34928 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apoc1P34928 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apoc1P34928 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apoc1P34928 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apoc1P34928 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apoc1P34928 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apoc1P34928 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apoc1P34928 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apoc1P34928 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apoc1P34928 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apoc1P34928 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apoc1P34928 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Apoc1P34928 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apoc1P34928 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apoc1P34928 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apoc1P34928 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apoc1P34928 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apoc1P34928 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Apoc1P34928 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apoc1P34928 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apoc1P34928 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apoc1P34928 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoc1P34928 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoc1P34928 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoc1P34928 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoc1P34928 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoc1P34928 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoc1P34928 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoc1P34928 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoc1P34928 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoc1P34928 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoc1P34928 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoc1P34928 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoc1P34928 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoc1P34928 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoc1P34928 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoc1P34928 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoc1P34928 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoc1P34928 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoc1P34928 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Apoc1P34928 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apoc1P34928 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apoc1P34928 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Apoc1P34928 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Apoc1P34928 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apoc1P34928 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apoc1P34928 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apoc1P34928 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apoc1P34928 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apoc1P34928 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Apoc1P34928 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Apoc1P34928 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apoc1P34928 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apoc1P34928 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apoc1P34928 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Apoc1P34928 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apoc1P34928 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apoc1P34928 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apoc1P34928 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apoc1P34928 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apoc1P34928 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apoc1P34928 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apoc1P34928 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apoc1P34928 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apoc1P34928 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Apoc1P34928 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apoc1P34928 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apoc1P34928 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apoc1P34928 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apoc1P34928 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apoc1P34928 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apoc1P34928 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apoc1P34928 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apoc1P34928 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apoc1P34928 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apoc1P34928 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apoc1P34928 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apoc1P34928 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apoc1P34928 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apoc1P34928 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apoc1P34928 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apoc1P34928 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apoc1P34928 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apoc1P34928 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apoc1P34928 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apoc1P34928 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apoc1P34928 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms