Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxa2P31245 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxa2P31245 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxa2P31245 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxa2P31245 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxa2P31245 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxa2P31245 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxa2P31245 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxa2P31245 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxa2P31245 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxa2P31245 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxa2P31245 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxa2P31245 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxa2P31245 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxa2P31245 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxa2P31245 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxa2P31245 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxa2P31245 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxa2P31245 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxa2P31245 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxa2P31245 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxa2P31245 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxa2P31245 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxa2P31245 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxa2P31245 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxa2P31245 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxa2P31245 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxa2P31245 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxa2P31245 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxa2P31245 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxa2P31245 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxa2P31245 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxa2P31245 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxa2P31245 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxa2P31245 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxa2P31245 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxa2P31245 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxa2P31245 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxa2P31245 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxa2P31245 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxa2P31245 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxa2P31245 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxa2P31245 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxa2P31245 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxa2P31245 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Hoxa2P31245 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxa2P31245 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxa2P31245 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxa2P31245 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxa2P31245 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxa2P31245 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxa2P31245 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxa2P31245 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxa2P31245 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxa2P31245 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxa2P31245 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxa2P31245 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxa2P31245 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxa2P31245 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxa2P31245 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxa2P31245 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxa2P31245 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxa2P31245 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxa2P31245 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxa2P31245 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxa2P31245 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxa2P31245 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxa2P31245 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxa2P31245 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxa2P31245 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxa2P31245 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxa2P31245 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxa2P31245 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxa2P31245 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxa2P31245 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxa2P31245 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxa2P31245 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxa2P31245 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxa2P31245 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxa2P31245 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxa2P31245 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxa2P31245 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxa2P31245 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxa2P31245 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxa2P31245 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxa2P31245 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxa2P31245 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxa2P31245 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxa2P31245 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxa2P31245 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxa2P31245 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxa2P31245 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxa2P31245 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxa2P31245 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxa2P31245 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxa2P31245 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxa2P31245 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxa2P31245 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxa2P31245 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxa2P31245 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms