Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd28P31041 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd28P31041 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd28P31041 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd28P31041 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd28P31041 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd28P31041 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd28P31041 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Cd28P31041 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd28P31041 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd28P31041 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd28P31041 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd28P31041 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd28P31041 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd28P31041 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd28P31041 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd28P31041 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd28P31041 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd28P31041 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd28P31041 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd28P31041 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd28P31041 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd28P31041 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd28P31041 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd28P31041 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd28P31041 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd28P31041 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd28P31041 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd28P31041 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd28P31041 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd28P31041 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd28P31041 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd28P31041 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd28P31041 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd28P31041 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd28P31041 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd28P31041 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd28P31041 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd28P31041 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd28P31041 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd28P31041 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd28P31041 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd28P31041 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd28P31041 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd28P31041 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd28P31041 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd28P31041 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd28P31041 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd28P31041 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd28P31041 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd28P31041 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd28P31041 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd28P31041 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd28P31041 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd28P31041 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd28P31041 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd28P31041 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd28P31041 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd28P31041 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd28P31041 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd28P31041 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd28P31041 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd28P31041 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd28P31041 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd28P31041 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd28P31041 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd28P31041 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd28P31041 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd28P31041 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd28P31041 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd28P31041 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd28P31041 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd28P31041 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd28P31041 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd28P31041 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd28P31041 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd28P31041 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd28P31041 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd28P31041 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd28P31041 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd28P31041 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd28P31041 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd28P31041 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd28P31041 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd28P31041 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd28P31041 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd28P31041 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd28P31041 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd28P31041 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd28P31041 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd28P31041 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd28P31041 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd28P31041 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd28P31041 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd28P31041 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd28P31041 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd28P31041 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd28P31041 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd28P31041 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd28P31041 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms