Protein–RNA interactions for Protein: P29452

Casp1, Caspase-1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp1P29452 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Casp1P29452 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Casp1P29452 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Casp1P29452 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Casp1P29452 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Casp1P29452 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Casp1P29452 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Casp1P29452 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Casp1P29452 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Casp1P29452 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Casp1P29452 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Casp1P29452 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Casp1P29452 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Casp1P29452 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Casp1P29452 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Casp1P29452 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Casp1P29452 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Casp1P29452 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Casp1P29452 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Casp1P29452 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Casp1P29452 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Casp1P29452 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Casp1P29452 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Casp1P29452 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Casp1P29452 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Casp1P29452 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Casp1P29452 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Casp1P29452 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Casp1P29452 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Casp1P29452 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Casp1P29452 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Casp1P29452 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Casp1P29452 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Casp1P29452 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Casp1P29452 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Casp1P29452 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Casp1P29452 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Casp1P29452 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Casp1P29452 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Casp1P29452 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Casp1P29452 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Casp1P29452 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Casp1P29452 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Casp1P29452 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Casp1P29452 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Casp1P29452 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Casp1P29452 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Casp1P29452 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Casp1P29452 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Casp1P29452 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Casp1P29452 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Casp1P29452 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Casp1P29452 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Casp1P29452 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Casp1P29452 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Casp1P29452 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Casp1P29452 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Casp1P29452 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Casp1P29452 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Casp1P29452 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Casp1P29452 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Casp1P29452 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Casp1P29452 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Casp1P29452 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Casp1P29452 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Casp1P29452 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Casp1P29452 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Casp1P29452 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Casp1P29452 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Casp1P29452 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Casp1P29452 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Casp1P29452 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Casp1P29452 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Casp1P29452 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Casp1P29452 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Casp1P29452 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Casp1P29452 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Casp1P29452 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Casp1P29452 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Casp1P29452 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Casp1P29452 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Casp1P29452 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Casp1P29452 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Casp1P29452 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Casp1P29452 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Casp1P29452 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Casp1P29452 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Casp1P29452 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Casp1P29452 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Casp1P29452 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Casp1P29452 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Casp1P29452 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Casp1P29452 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Casp1P29452 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Casp1P29452 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Casp1P29452 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Casp1P29452 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Casp1P29452 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Casp1P29452 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Casp1P29452 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms