Protein–RNA interactions for Protein: P29416

Hexa, Beta-hexosaminidase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HexaP29416 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HexaP29416 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HexaP29416 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HexaP29416 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HexaP29416 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HexaP29416 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HexaP29416 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HexaP29416 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HexaP29416 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HexaP29416 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HexaP29416 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HexaP29416 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HexaP29416 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HexaP29416 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HexaP29416 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HexaP29416 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HexaP29416 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HexaP29416 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HexaP29416 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HexaP29416 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HexaP29416 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HexaP29416 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HexaP29416 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HexaP29416 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HexaP29416 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HexaP29416 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HexaP29416 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HexaP29416 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HexaP29416 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HexaP29416 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HexaP29416 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HexaP29416 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HexaP29416 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HexaP29416 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HexaP29416 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HexaP29416 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HexaP29416 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HexaP29416 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
HexaP29416 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HexaP29416 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HexaP29416 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HexaP29416 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HexaP29416 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HexaP29416 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HexaP29416 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HexaP29416 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HexaP29416 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HexaP29416 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HexaP29416 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HexaP29416 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HexaP29416 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HexaP29416 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HexaP29416 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HexaP29416 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HexaP29416 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HexaP29416 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HexaP29416 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HexaP29416 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HexaP29416 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HexaP29416 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HexaP29416 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HexaP29416 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HexaP29416 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HexaP29416 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HexaP29416 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HexaP29416 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HexaP29416 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HexaP29416 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HexaP29416 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HexaP29416 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HexaP29416 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HexaP29416 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HexaP29416 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HexaP29416 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HexaP29416 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HexaP29416 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HexaP29416 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HexaP29416 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HexaP29416 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HexaP29416 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HexaP29416 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HexaP29416 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HexaP29416 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HexaP29416 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HexaP29416 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HexaP29416 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HexaP29416 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HexaP29416 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HexaP29416 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HexaP29416 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HexaP29416 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HexaP29416 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HexaP29416 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HexaP29416 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HexaP29416 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HexaP29416 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HexaP29416 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HexaP29416 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HexaP29416 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HexaP29416 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms