Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PtprmP28828 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PtprmP28828 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PtprmP28828 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PtprmP28828 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PtprmP28828 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PtprmP28828 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PtprmP28828 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PtprmP28828 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PtprmP28828 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PtprmP28828 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PtprmP28828 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PtprmP28828 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PtprmP28828 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PtprmP28828 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PtprmP28828 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PtprmP28828 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PtprmP28828 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PtprmP28828 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PtprmP28828 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PtprmP28828 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PtprmP28828 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PtprmP28828 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PtprmP28828 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PtprmP28828 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PtprmP28828 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PtprmP28828 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PtprmP28828 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PtprmP28828 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PtprmP28828 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PtprmP28828 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PtprmP28828 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PtprmP28828 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PtprmP28828 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PtprmP28828 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PtprmP28828 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PtprmP28828 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PtprmP28828 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PtprmP28828 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PtprmP28828 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PtprmP28828 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PtprmP28828 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PtprmP28828 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PtprmP28828 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PtprmP28828 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PtprmP28828 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PtprmP28828 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PtprmP28828 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PtprmP28828 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PtprmP28828 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PtprmP28828 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PtprmP28828 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PtprmP28828 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PtprmP28828 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PtprmP28828 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PtprmP28828 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PtprmP28828 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PtprmP28828 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PtprmP28828 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PtprmP28828 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PtprmP28828 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PtprmP28828 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PtprmP28828 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PtprmP28828 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PtprmP28828 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PtprmP28828 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PtprmP28828 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PtprmP28828 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PtprmP28828 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PtprmP28828 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PtprmP28828 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PtprmP28828 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PtprmP28828 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PtprmP28828 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PtprmP28828 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PtprmP28828 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PtprmP28828 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PtprmP28828 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PtprmP28828 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PtprmP28828 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PtprmP28828 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PtprmP28828 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PtprmP28828 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PtprmP28828 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PtprmP28828 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PtprmP28828 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PtprmP28828 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PtprmP28828 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PtprmP28828 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PtprmP28828 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PtprmP28828 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PtprmP28828 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PtprmP28828 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PtprmP28828 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PtprmP28828 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PtprmP28828 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PtprmP28828 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PtprmP28828 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PtprmP28828 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PtprmP28828 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
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