Protein–RNA interactions for Protein: P28571

Slc6a9, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a9P28571 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc6a9P28571 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc6a9P28571 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc6a9P28571 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc6a9P28571 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc6a9P28571 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc6a9P28571 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc6a9P28571 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc6a9P28571 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc6a9P28571 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc6a9P28571 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc6a9P28571 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc6a9P28571 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc6a9P28571 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc6a9P28571 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc6a9P28571 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc6a9P28571 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc6a9P28571 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc6a9P28571 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc6a9P28571 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc6a9P28571 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc6a9P28571 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc6a9P28571 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc6a9P28571 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc6a9P28571 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc6a9P28571 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc6a9P28571 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc6a9P28571 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc6a9P28571 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc6a9P28571 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc6a9P28571 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc6a9P28571 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc6a9P28571 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc6a9P28571 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc6a9P28571 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc6a9P28571 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc6a9P28571 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc6a9P28571 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Slc6a9P28571 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc6a9P28571 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc6a9P28571 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc6a9P28571 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc6a9P28571 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Slc6a9P28571 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc6a9P28571 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc6a9P28571 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc6a9P28571 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc6a9P28571 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc6a9P28571 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc6a9P28571 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc6a9P28571 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc6a9P28571 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc6a9P28571 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc6a9P28571 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc6a9P28571 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc6a9P28571 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc6a9P28571 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc6a9P28571 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc6a9P28571 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc6a9P28571 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Slc6a9P28571 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc6a9P28571 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc6a9P28571 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc6a9P28571 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc6a9P28571 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc6a9P28571 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc6a9P28571 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc6a9P28571 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc6a9P28571 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc6a9P28571 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Slc6a9P28571 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc6a9P28571 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc6a9P28571 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc6a9P28571 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc6a9P28571 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc6a9P28571 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc6a9P28571 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Slc6a9P28571 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc6a9P28571 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc6a9P28571 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc6a9P28571 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc6a9P28571 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc6a9P28571 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Slc6a9P28571 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc6a9P28571 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc6a9P28571 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc6a9P28571 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Slc6a9P28571 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Slc6a9P28571 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc6a9P28571 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc6a9P28571 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Slc6a9P28571 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc6a9P28571 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc6a9P28571 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc6a9P28571 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Slc6a9P28571 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Slc6a9P28571 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Slc6a9P28571 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc6a9P28571 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc6a9P28571 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms