Protein–RNA interactions for Protein: P27641

Xrcc5, X-ray repair cross-complementing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 732 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc5P27641 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Xrcc5P27641 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Xrcc5P27641 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Xrcc5P27641 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Xrcc5P27641 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Xrcc5P27641 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Xrcc5P27641 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Xrcc5P27641 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Xrcc5P27641 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Xrcc5P27641 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Xrcc5P27641 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Xrcc5P27641 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Xrcc5P27641 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Xrcc5P27641 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Xrcc5P27641 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Xrcc5P27641 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Xrcc5P27641 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Xrcc5P27641 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Xrcc5P27641 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Xrcc5P27641 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Xrcc5P27641 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Xrcc5P27641 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Xrcc5P27641 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Xrcc5P27641 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Xrcc5P27641 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Xrcc5P27641 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Xrcc5P27641 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Xrcc5P27641 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Xrcc5P27641 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Xrcc5P27641 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Xrcc5P27641 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Xrcc5P27641 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Xrcc5P27641 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Xrcc5P27641 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Xrcc5P27641 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Xrcc5P27641 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Xrcc5P27641 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Xrcc5P27641 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Xrcc5P27641 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Xrcc5P27641 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Xrcc5P27641 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Xrcc5P27641 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Xrcc5P27641 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Xrcc5P27641 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Xrcc5P27641 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Xrcc5P27641 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Xrcc5P27641 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Xrcc5P27641 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Xrcc5P27641 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Xrcc5P27641 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Xrcc5P27641 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Xrcc5P27641 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Xrcc5P27641 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Xrcc5P27641 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Xrcc5P27641 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Xrcc5P27641 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Xrcc5P27641 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Xrcc5P27641 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Xrcc5P27641 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Xrcc5P27641 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Xrcc5P27641 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Xrcc5P27641 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Xrcc5P27641 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Xrcc5P27641 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Xrcc5P27641 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Xrcc5P27641 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Xrcc5P27641 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Xrcc5P27641 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Xrcc5P27641 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Xrcc5P27641 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Xrcc5P27641 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Xrcc5P27641 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Xrcc5P27641 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Xrcc5P27641 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Xrcc5P27641 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Xrcc5P27641 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Xrcc5P27641 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Xrcc5P27641 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Xrcc5P27641 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Xrcc5P27641 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Xrcc5P27641 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Xrcc5P27641 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Xrcc5P27641 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Xrcc5P27641 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Xrcc5P27641 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Xrcc5P27641 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Xrcc5P27641 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Xrcc5P27641 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Xrcc5P27641 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Xrcc5P27641 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Xrcc5P27641 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Xrcc5P27641 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Xrcc5P27641 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Xrcc5P27641 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Xrcc5P27641 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Xrcc5P27641 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Xrcc5P27641 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Xrcc5P27641 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Xrcc5P27641 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Xrcc5P27641 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
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