Protein–RNA interactions for Protein: P27548

Cd40lg, CD40 ligand, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd40lgP27548 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd40lgP27548 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd40lgP27548 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd40lgP27548 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd40lgP27548 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd40lgP27548 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd40lgP27548 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd40lgP27548 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd40lgP27548 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd40lgP27548 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd40lgP27548 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd40lgP27548 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd40lgP27548 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd40lgP27548 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd40lgP27548 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd40lgP27548 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd40lgP27548 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd40lgP27548 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd40lgP27548 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd40lgP27548 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd40lgP27548 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd40lgP27548 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd40lgP27548 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd40lgP27548 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd40lgP27548 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd40lgP27548 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd40lgP27548 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd40lgP27548 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd40lgP27548 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd40lgP27548 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd40lgP27548 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd40lgP27548 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd40lgP27548 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd40lgP27548 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd40lgP27548 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd40lgP27548 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd40lgP27548 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd40lgP27548 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd40lgP27548 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd40lgP27548 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd40lgP27548 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd40lgP27548 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd40lgP27548 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd40lgP27548 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd40lgP27548 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd40lgP27548 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd40lgP27548 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd40lgP27548 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd40lgP27548 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd40lgP27548 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd40lgP27548 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd40lgP27548 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd40lgP27548 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd40lgP27548 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd40lgP27548 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd40lgP27548 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd40lgP27548 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd40lgP27548 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd40lgP27548 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd40lgP27548 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd40lgP27548 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd40lgP27548 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd40lgP27548 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd40lgP27548 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd40lgP27548 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd40lgP27548 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd40lgP27548 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd40lgP27548 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd40lgP27548 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd40lgP27548 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd40lgP27548 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd40lgP27548 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd40lgP27548 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd40lgP27548 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd40lgP27548 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd40lgP27548 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd40lgP27548 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd40lgP27548 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd40lgP27548 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd40lgP27548 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd40lgP27548 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd40lgP27548 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd40lgP27548 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd40lgP27548 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd40lgP27548 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd40lgP27548 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd40lgP27548 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd40lgP27548 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd40lgP27548 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd40lgP27548 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd40lgP27548 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd40lgP27548 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd40lgP27548 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd40lgP27548 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd40lgP27548 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd40lgP27548 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd40lgP27548 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cd40lgP27548 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cd40lgP27548 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cd40lgP27548 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms