Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ChgaP26339 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ChgaP26339 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ChgaP26339 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ChgaP26339 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ChgaP26339 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ChgaP26339 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ChgaP26339 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ChgaP26339 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ChgaP26339 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ChgaP26339 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ChgaP26339 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ChgaP26339 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ChgaP26339 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ChgaP26339 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ChgaP26339 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ChgaP26339 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ChgaP26339 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ChgaP26339 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ChgaP26339 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ChgaP26339 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ChgaP26339 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ChgaP26339 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ChgaP26339 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ChgaP26339 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ChgaP26339 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ChgaP26339 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ChgaP26339 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ChgaP26339 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ChgaP26339 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ChgaP26339 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ChgaP26339 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ChgaP26339 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ChgaP26339 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ChgaP26339 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ChgaP26339 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ChgaP26339 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ChgaP26339 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ChgaP26339 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ChgaP26339 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ChgaP26339 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ChgaP26339 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ChgaP26339 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ChgaP26339 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ChgaP26339 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ChgaP26339 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ChgaP26339 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ChgaP26339 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ChgaP26339 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ChgaP26339 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ChgaP26339 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ChgaP26339 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ChgaP26339 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ChgaP26339 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ChgaP26339 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ChgaP26339 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ChgaP26339 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ChgaP26339 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ChgaP26339 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ChgaP26339 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ChgaP26339 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ChgaP26339 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ChgaP26339 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ChgaP26339 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ChgaP26339 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ChgaP26339 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ChgaP26339 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ChgaP26339 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ChgaP26339 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ChgaP26339 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ChgaP26339 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ChgaP26339 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ChgaP26339 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ChgaP26339 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ChgaP26339 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ChgaP26339 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ChgaP26339 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ChgaP26339 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ChgaP26339 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ChgaP26339 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ChgaP26339 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ChgaP26339 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ChgaP26339 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ChgaP26339 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ChgaP26339 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ChgaP26339 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ChgaP26339 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ChgaP26339 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ChgaP26339 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ChgaP26339 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ChgaP26339 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ChgaP26339 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ChgaP26339 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ChgaP26339 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ChgaP26339 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ChgaP26339 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ChgaP26339 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ChgaP26339 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ChgaP26339 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ChgaP26339 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms