Protein–RNA interactions for Protein: P25911

Lyn, Tyrosine-protein kinase Lyn, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LynP25911 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LynP25911 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LynP25911 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LynP25911 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LynP25911 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LynP25911 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
LynP25911 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LynP25911 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LynP25911 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LynP25911 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LynP25911 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LynP25911 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LynP25911 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LynP25911 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LynP25911 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LynP25911 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LynP25911 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LynP25911 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LynP25911 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LynP25911 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LynP25911 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LynP25911 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LynP25911 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LynP25911 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LynP25911 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
LynP25911 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LynP25911 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LynP25911 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LynP25911 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LynP25911 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LynP25911 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LynP25911 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LynP25911 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LynP25911 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LynP25911 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LynP25911 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LynP25911 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LynP25911 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
LynP25911 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LynP25911 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LynP25911 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LynP25911 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LynP25911 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LynP25911 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LynP25911 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
LynP25911 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LynP25911 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
LynP25911 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LynP25911 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LynP25911 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LynP25911 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LynP25911 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LynP25911 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LynP25911 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LynP25911 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LynP25911 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LynP25911 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LynP25911 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LynP25911 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LynP25911 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LynP25911 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LynP25911 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LynP25911 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LynP25911 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
LynP25911 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LynP25911 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LynP25911 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LynP25911 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LynP25911 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LynP25911 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LynP25911 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LynP25911 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LynP25911 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LynP25911 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LynP25911 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LynP25911 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LynP25911 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LynP25911 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LynP25911 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
LynP25911 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LynP25911 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LynP25911 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LynP25911 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LynP25911 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LynP25911 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LynP25911 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LynP25911 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LynP25911 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LynP25911 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LynP25911 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LynP25911 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LynP25911 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LynP25911 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LynP25911 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LynP25911 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LynP25911 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LynP25911 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LynP25911 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LynP25911 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LynP25911 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms