Protein–RNA interactions for Protein: P25425

Pou2f1, POU domain, class 2, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou2f1P25425 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pou2f1P25425 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pou2f1P25425 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pou2f1P25425 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pou2f1P25425 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pou2f1P25425 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pou2f1P25425 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pou2f1P25425 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pou2f1P25425 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pou2f1P25425 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pou2f1P25425 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pou2f1P25425 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pou2f1P25425 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pou2f1P25425 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pou2f1P25425 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pou2f1P25425 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pou2f1P25425 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pou2f1P25425 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Pou2f1P25425 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Pou2f1P25425 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Pou2f1P25425 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Pou2f1P25425 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Pou2f1P25425 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pou2f1P25425 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pou2f1P25425 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pou2f1P25425 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pou2f1P25425 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pou2f1P25425 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pou2f1P25425 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pou2f1P25425 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pou2f1P25425 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pou2f1P25425 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pou2f1P25425 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pou2f1P25425 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pou2f1P25425 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pou2f1P25425 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou2f1P25425 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou2f1P25425 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou2f1P25425 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou2f1P25425 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou2f1P25425 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou2f1P25425 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou2f1P25425 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou2f1P25425 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou2f1P25425 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou2f1P25425 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou2f1P25425 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou2f1P25425 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou2f1P25425 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou2f1P25425 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou2f1P25425 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou2f1P25425 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou2f1P25425 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou2f1P25425 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou2f1P25425 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou2f1P25425 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou2f1P25425 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou2f1P25425 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou2f1P25425 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pou2f1P25425 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pou2f1P25425 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pou2f1P25425 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pou2f1P25425 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pou2f1P25425 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pou2f1P25425 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pou2f1P25425 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pou2f1P25425 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pou2f1P25425 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pou2f1P25425 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pou2f1P25425 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pou2f1P25425 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pou2f1P25425 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pou2f1P25425 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pou2f1P25425 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pou2f1P25425 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pou2f1P25425 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pou2f1P25425 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pou2f1P25425 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pou2f1P25425 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou2f1P25425 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou2f1P25425 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou2f1P25425 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou2f1P25425 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou2f1P25425 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou2f1P25425 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou2f1P25425 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou2f1P25425 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou2f1P25425 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou2f1P25425 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou2f1P25425 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou2f1P25425 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou2f1P25425 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou2f1P25425 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou2f1P25425 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou2f1P25425 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou2f1P25425 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou2f1P25425 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou2f1P25425 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou2f1P25425 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou2f1P25425 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms