Protein–RNA interactions for Protein: P23607

Zfa, Zinc finger autosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZfaP23607 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZfaP23607 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZfaP23607 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZfaP23607 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZfaP23607 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZfaP23607 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZfaP23607 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZfaP23607 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ZfaP23607 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZfaP23607 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZfaP23607 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZfaP23607 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZfaP23607 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZfaP23607 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZfaP23607 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZfaP23607 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZfaP23607 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZfaP23607 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZfaP23607 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZfaP23607 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZfaP23607 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZfaP23607 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZfaP23607 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZfaP23607 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZfaP23607 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZfaP23607 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ZfaP23607 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZfaP23607 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZfaP23607 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZfaP23607 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZfaP23607 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZfaP23607 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZfaP23607 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZfaP23607 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZfaP23607 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZfaP23607 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZfaP23607 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZfaP23607 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZfaP23607 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZfaP23607 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZfaP23607 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZfaP23607 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZfaP23607 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZfaP23607 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZfaP23607 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZfaP23607 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZfaP23607 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZfaP23607 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZfaP23607 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZfaP23607 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZfaP23607 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZfaP23607 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZfaP23607 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZfaP23607 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZfaP23607 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZfaP23607 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZfaP23607 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZfaP23607 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZfaP23607 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZfaP23607 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZfaP23607 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZfaP23607 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZfaP23607 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZfaP23607 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZfaP23607 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZfaP23607 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZfaP23607 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ZfaP23607 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZfaP23607 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZfaP23607 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZfaP23607 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZfaP23607 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZfaP23607 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZfaP23607 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZfaP23607 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZfaP23607 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZfaP23607 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZfaP23607 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZfaP23607 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZfaP23607 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZfaP23607 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZfaP23607 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ZfaP23607 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZfaP23607 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZfaP23607 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZfaP23607 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZfaP23607 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZfaP23607 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZfaP23607 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZfaP23607 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZfaP23607 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ZfaP23607 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZfaP23607 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZfaP23607 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ZfaP23607 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZfaP23607 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZfaP23607 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZfaP23607 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZfaP23607 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZfaP23607 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms